RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476784.5

TTC3-215, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 2

Gene TTC3, Length 7,425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-215	ENST00000476784	PDCD6	O75340	191 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	FAM157C	P0CG43	387 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	C2orf83	Q53S99	150 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	C2orf50	Q96LR7	162 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	RTTN	Q86VV8	2226 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	TRDC	B7Z8K6	153 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	CTGF	P29279	349 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	ZNF737	O75373	536 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	ALPL	P05186	524 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	COX6C	P09669	75 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	S100A11	P31949	105 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	SSTR5	P35346	364 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	NUBPL	Q8TB37	319 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	PHYHIP	Q92561	330 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	KLK2	P20151	261 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	MC5R	P33032	325 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	RAB33B	Q9H082	229 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	ANOS1	P23352	680 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	5.82	□□□□□ -1.48	5e-7	■□□□□ 8
TTC3-215	ENST00000476784	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	KHDC3L	Q587J8	217 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	OTOS	Q8NHW6	89 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784		A0A087WX48	190 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	CORT	O00230	105 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	TAAR5	O14804	337 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	MFAP2	P55001	183 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	CYS1	Q717R9	158 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	RNF122	Q9H9V4	155 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	RASL12	Q9NYN1	266 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	RNF114	Q9Y508	228 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784		A0A0A6YYD5	115 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	IGKV1D-33	P01593	117 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	IGKV1-33	P01594	117 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	IGHV3-48	P01763	117 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	PSMB6	P28072	239 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	MARC2	Q969Z3	335 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	WDR54	Q9H977	334 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	CST2	P09228	141 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	RND2	P52198	227 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	NMU	P48645	174 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	ZNF383	Q8NA42	475 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	GALNT14	Q96FL9	552 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	EFNB2	P52799	333 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	TMEM42	Q69YG0	159 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	ZNF429	Q86V71	674 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	SEC11C	Q9BY50	192 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	AMY1A	P04745	511 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-215	ENST00000476784	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		5.81	□□□□□ -1.48

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