RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472420.5

LRPPRC-208, Transcript of leucine rich pentatricopeptide repeat containing, human

TSL 2

Gene LRPPRC, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRPPRC-208	ENST00000472420	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	RAB17	Q9H0T7	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	GMEB1	Q9Y692	573 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420		A0A087WTM6	91 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SMIM23	A6NLE4	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	COPE	O14579	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	LANCL1	O43813	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TUSC2	O75896	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR2C1	O95371	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	C8orf88	P0DMB2	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	PRKACA	P17612	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	OPRL1	P41146	370 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	LGALS7	P47929	136 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	FXYD6P3	P58550	94 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	LINC00315	P59091	139 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TMEM42	Q69YG0	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SORT1	Q99523	831 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420		A0A0U1RQV5	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ARPC3	O15145	178 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC31A2	O15432	143 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	CA2	P00918	260 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	HTN3	P15516	51 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF44	P15621	663 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TRAM2	Q15035	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420		Q3ZCU0	254 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	EVPLL	A8MZ36	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	SDHD	O14521	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	IDH3B	O43837	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	C1QB	P02746	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	CALCB	P10092	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	BCL3	P20749	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	FMO3	P31513	532 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	FXYD3	Q14802	87 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LRPPRC-208	ENST00000472420	OR2T4	Q8NH00	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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