RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470953.1

VARS-222, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene VARS, Length 392 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-222	ENST00000470953	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	MUL1	Q969V5	352 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	RPE	Q96AT9	228 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CNBD2	Q96M20	576 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CST11	Q9H112	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953		Q9H521	79 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.63	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	AIP	O00170	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	OGG1	O15527	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	LALBA	P00709	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CDK1	P06493	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	IL3RA	P26951	378 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	BRS3	P32247	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	MNDA	P41218	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	GNG10	P50151	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	PRRX1	P54821	245 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	DLX6	P56179	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	BDH1	Q02338	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SPHAR	Q15513	63 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	AANAT	Q16613	207 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TCF23	Q7RTU1	214 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	DERL3	Q96Q80	235 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ZNF649	Q9BS31	505 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.62	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	LEUTX	A8MZ59	168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SHOX	O15266	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SPINT2	O43291	252 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SNAPIN	O95295	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	BPNT1	O95861	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	IL1A	P01583	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	LPL	P06858	475 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	MGMT	P16455	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	SSTR5	P35346	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	HES1	Q14469	280 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ZNF124	Q15973	351 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
VARS-222	ENST00000470953		Q6P435	159 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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