RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466832.5

TRA2B-209, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 2

Gene TRA2B, Length 2,414 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-209	ENST00000466832	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF75A	Q96N20	296 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ANK2	Q01484	3957 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832		A0A087X0M5	115 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832		A0A1B0GX30	115 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	BTBD17	A6NE02	478 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832		H0Y980	276 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ATG12	O94817	140 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PPY	P01298	95 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	LIPC	P11150	499 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	UCP1	P25874	307 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	CAV2	P51636	162 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PAX5	Q02548	391 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	PIGC	Q92535	297 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.9	□□□□□ -1.62
TRA2B-209	ENST00000466832	CACNA1C	Q13936	2221 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	MPPED1	O15442	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	PITX3	O75364	302 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	ADAP1	O75689	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	SNAPIN	O95295	136 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	SFTPB	P07988	381 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	LMO1	P25800	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	FCGR2C	P31995	323 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	TGFBR3	Q03167	851 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	MICU1	Q9BPX6	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	CLCF1	Q9UBD9	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	ANGPTL7	O43827	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	MAGEA5	P43359	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TRA2B-209	ENST00000466832	ZNF266	Q14584	549 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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