RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465576.1

CLRN1-AS1-201, CLRN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN1-AS1, Length 2,045 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CLN8Q9UBY8 286 aa5.31□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF69Q9UC07 566 aa5.31□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 VSIG4Q9Y279 399 aa5.31□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MED13LQ71F56 2210 aa5.31□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 APCP25054 2843 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C15orf65H3BRN8 121 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IGHV3-7P01780 117 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 WNT2P09544 360 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF728P0DKX0 622 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AKR1C4P17516 323 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GNB2P62879 340 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CBX3Q13185 183 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF273Q14593 569 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GNMTQ14749 295 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CLEC2AQ6UVW9 174 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF841Q6ZN19 808 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TCF23Q7RTU1 214 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SECTM1Q8WVN6 248 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CAPSLQ8WWF8 208 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM168AQ92567 244 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RDH8Q9NYR8 311 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CALYQ9NYX4 217 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GNG12Q9UBI6 72 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ALG5Q9Y673 324 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 VPS13CQ709C8 3753 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NAV2Q8IVL1 2488 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 A0A0A6YYJ9 748 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HEXAP06865 529 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CCL3L1P16619 93 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FPR2P25090 351 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NFYBP25208 207 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 BCAP31P51572 246 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ERVFRD-1P60508 538 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C17orf58Q2M2W7 97 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CR1LQ2VPA4 569 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C4orf46Q504U0 113 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ESCO2Q56NI9 601 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CADM3Q8N126 398 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZDHHC22Q8N966 263 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MOB3AQ96BX8 217 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RHOVQ96L33 236 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF714Q96N38 554 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SEC22CQ9BRL7 303 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FXYD6Q9H0Q3 95 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GPR132Q9UNW8 380 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OR2W1Q9Y3N9 320 aa5.3□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HSD17B6O14756 317 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TUSC2O75896 110 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OR8U9P0C7N5 309 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 VSIG10L2P0DP72 767 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ECI1P42126 302 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LUMP51884 338 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RAG2P55895 527 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HTD2P86397 168 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OR8U1Q8NH10 309 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZFAND1Q8TCF1 268 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CORO2AQ92828 525 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LEAP2Q969E1 77 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM210AQ96ND0 272 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NEURL2Q9BR09 285 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GSX2Q9BZM3 304 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RAB9BQ9NP90 201 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 OPN4Q9UHM6 478 aa5.29□□□□□ -1.56
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KCNS2Q9ULS6 477 aa5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms