RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 FAM172BPA6NC97 362 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 GABARAPH6UMI1 98 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 FABP7O15540 132 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 FCER2P06734 321 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3-43DP0DP04 118 aa8.35□□□□□ -1.07
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GARNL3-211ENST00000460176 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
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GARNL3-211ENST00000460176 KIR2DS4P43632 304 aa8.35□□□□□ -1.07
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GARNL3-211ENST00000460176 GNMTQ14749 295 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 KIR2DS1Q14954 304 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 OR52W1Q6IF63 320 aa8.35□□□□□ -1.07
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GARNL3-211ENST00000460176 OR52I2Q8NH67 350 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 LEAP2Q969E1 77 aa8.35□□□□□ -1.07
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GARNL3-211ENST00000460176 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa8.35□□□□□ -1.07
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GARNL3-211ENST00000460176 GFOD1Q9NXC2 390 aa8.35□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.35□□□□□ -1.07
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GARNL3-211ENST00000460176 IGHV1-69P01742 117 aa8.34□□□□□ -1.07
GARNL3-211ENST00000460176 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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GARNL3-211ENST00000460176 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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GARNL3-211ENST00000460176 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa8.34□□□□□ -1.07
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GARNL3-211ENST00000460176 MTFP1Q9UDX5 166 aa8.34□□□□□ -1.07
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GARNL3-211ENST00000460176 A0A1W2PRM7 423 aa8.33□□□□□ -1.08
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GARNL3-211ENST00000460176 LCE2BO14633 110 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 NPFFO15130 113 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 YPEL1O60688 119 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 IGLV1-47P01700 117 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV3-7P01780 117 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 HNF1AP20823 631 aa8.33□□□□□ -1.08
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GARNL3-211ENST00000460176 TEX29Q8N6K0 151 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 OR9G1Q8NH87 305 aa8.33□□□□□ -1.08
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GARNL3-211ENST00000460176 NUP50Q9UKX7 468 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 PSG11Q9UQ72 335 aa8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 J3QR06 171 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 BET1O15155 118 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 SLC31A2O15432 143 aa8.32□□□□□ -1.08
GARNL3-211ENST00000460176 LANCL1O43813 399 aa8.32□□□□□ -1.08
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