RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa10.16□□□□□ -0.78
PRAME-208ENST00000438888 TIMM23O14925 209 aa10.16□□□□□ -0.78
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PRAME-208ENST00000438888 RBBP9O75884 186 aa10.16□□□□□ -0.78
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PRAME-208ENST00000438888 ERP29P30040 261 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
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PRAME-208ENST00000438888 BEST4Q8NFU0 473 aa10.14□□□□□ -0.79
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PRAME-208ENST00000438888 TOMM5Q8N4H5 51 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-208ENST00000438888 OR13A1Q8NGR1 328 aa10.13□□□□□ -0.79
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PRAME-208ENST00000438888 SNAPC3Q92966 411 aa10.13□□□□□ -0.79
PRAME-208ENST00000438888 DPAGT1Q9H3H5 408 aa10.13□□□□□ -0.79
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