RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF44	P15621	663 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	CTLA4	P16410	223 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	PMEL	P40967	661 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	KIR2DS4	P43632	304 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	OR1E2	P47887	323 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ERF	P50548	548 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	UBE2E1	P51965	193 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	LCN6	P62502	163 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	PRKCD	Q05655	676 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	MAB21L1	Q13394	359 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ATRAID	Q6UW56	229 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	NRM	Q8IXM6	262 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	MICU2	Q8IYU8	434 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	OR8S1	Q8NH09	359 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	SPTSSA	Q969W0	71 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	PRRC1	Q96M27	445 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	SIRPD	Q9H106	197 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	SYT4	Q9H2B2	425 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	WDR76	Q9H967	626 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	GID8	Q9NWU2	228 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	TENM3	Q9P273	2699 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A1W2PRD5	423 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A1W2PRF3	423 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A1W2PRM7	423 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A1W2PRV1	198 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283		H3BUX3	64 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283		M0R135	149 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283		M0R1W7	72 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	BHLHE40	O14503	412 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF682	O95780	498 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	CLIC3	O95833	236 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	NPPA	P01160	153 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ALDOB	P05062	364 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ACSM4	P0C7M7	580 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF823	P16415	610 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	KDELR2	P33947	212 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	DDOST	P39656	456 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	GPR4	P46093	362 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	EFNB2	P52799	333 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	SELENOW	P63302	87 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	SELPLG	Q14242	412 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	SNCB	Q16143	134 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	AANAT	Q16613	207 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	MEST	Q5EB52	335 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	DRAM2	Q6UX65	266 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	FAM122B	Q7Z309	247 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	FTMT	Q8N4E7	242 aa		2.68	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		2.68	□□□□□ -1.98

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