RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 NEUROG1Q92886 237 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 C14orf79Q96F83 325 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 GAFA1Q96PS6 74 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 LIME1Q9H400 295 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 NAA60Q9H7X0 242 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.17□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 C3orf80F5H4A9 247 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 GPR37O15354 613 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 HBZP02008 142 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 DANCRP0C864 163 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 CXCL3P19876 107 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 GNRHRP30968 328 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 IL2RGP31785 369 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 BVESQ8NE79 360 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 NINJ1Q92982 152 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 TOMM40LQ969M1 308 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 METRNQ9UJH8 293 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 JPT1Q9UK76 154 aa8.16□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 ACANP16112 2415 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 hADV38S2A0JD32 116 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 A6NNC1 897 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 C12orf77C9JDV5 145 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 C15orf65H3BRN8 121 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 F2RL2O00254 374 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 MPPED1O15442 326 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 HSPA12AO43301 675 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 YPEL1O60688 119 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 CD8AP01732 235 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 CGB3P0DN86 165 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 CGB7P0DN87 165 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 C4BPBP20851 252 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 GLIPR1P48060 266 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 FXYD4P59646 89 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 BAMBIQ13145 260 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 Q3ZCU0 254 aa8.15□□□□□ -1.1
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POLR1A-202ENST00000409024 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 LGI3Q8N145 548 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 CCL17Q92583 94 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 IL22RA2Q969J5 263 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 ARL11Q969Q4 196 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 YPEL2Q96QA6 119 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 NMES1Q9C002 83 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 RDH8Q9NYR8 311 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 GAB2Q9UQC2 676 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 CADP27708 2225 aa8.15□□□□□ -1.1
POLR1A-202ENST00000409024 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 RNF212BA8MTL3 300 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 HMSDA8MTL9 139 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 A8MV72 311 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 GOSR2O14653 212 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFB3O43676 98 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 IFNA21P01568 189 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 GYPAP02724 150 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 COX6B1P14854 86 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 DNASE1P24855 282 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 CEACAM6P40199 344 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TLE4Q04727 773 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM187Q14656 261 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 SECTM1Q8WVN6 248 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 RAB39BQ96DA2 213 aa8.14□□□□□ -1.11
POLR1A-202ENST00000409024 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.14□□□□□ -1.11
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