RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB11BQ15907 218 aa16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 SSX1Q16384 188 aa16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 C5orf24Q7Z6I8 188 aa16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 ARSBP15848 533 aa16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF134P52741 427 aa16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 GABARAPL2P60520 117 aa16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 DEFA6Q01524 100 aa16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 OR2W3Q7Z3T1 314 aa16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 OR5AU1Q8NGC0 362 aa16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 OR2S2Q9NQN1 319 aa16.1■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 VWFP04275 2813 aa16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A0A6YYD4 124 aa16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNAB3O43448 404 aa16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 CT45A1Q5HYN5 189 aa16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF554Q86TJ5 538 aa16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 NDUFA11Q86Y39 141 aa16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 OR52L2PQ8NGH6 319 aa16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 CT45A3Q8NHU0 189 aa16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 LPAR5Q9H1C0 372 aa16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 Q9H521 79 aa16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa16.09■□□□□ 0.17
ANKRD39-201ENST00000393537 CLDN12P56749 244 aa16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 GNMTQ14749 295 aa16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 MORN2Q502X0 79 aa16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 C5orf56Q8N8D9 126 aa16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 NDUFB11Q9NX14 153 aa16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 V9GY05 133 aa16.08■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 SOCS1O15524 211 aa16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 DENRO43583 198 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF137PP52743 207 aa16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 EBI3Q14213 229 aa16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 HMGN3Q15651 99 aa16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 STEAP3Q658P3 488 aa16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 IZUMO1Q8IYV9 350 aa16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 SVOPQ8N4V2 548 aa16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 OR51D1Q8NGF3 324 aa16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 GALMQ96C23 342 aa16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 JPT1Q9UK76 154 aa16.07■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 FGF16O43320 207 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 NAPSAO96009 420 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 OPN1MWP04001 364 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 OPN1MW2P0DN77 364 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 OPN1MW3P0DN78 364 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 PSMD7P51665 324 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 HTD2P86397 168 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CD83Q01151 205 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 HES5Q5TA89 166 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM89BQ8N5H3 189 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 OR2T10Q8NGZ9 312 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 SETD6Q8TBK2 473 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM3DQ96BQ1 224 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 R3HDM4Q96D70 268 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 ABRACLQ9P1F3 81 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC42Q9Y546 428 aa16.06■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1W2PRX2 142 aa16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 PLXNB1O43157 2135 aa16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 TXNL1O43396 289 aa16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CD1BP29016 333 aa16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 C2orf76Q3KRA6 126 aa16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 C10orf99Q6UWK7 81 aa16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 Q6ZPA2 131 aa16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 C1QL4Q86Z23 238 aa16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 Q8N6K4 173 aa16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 OR4F17Q8NGA8 305 aa16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 OR4F4Q96R69 305 aa16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 AK3Q9UIJ7 227 aa16.05■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 SHISA3A0PJX4 238 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 PDCD5O14737 125 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 YPEL1O60688 119 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 RGS11O94810 467 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 MYL9P24844 172 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 VEGFCP49767 419 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 OR10A3P58181 314 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 UBE2UQ5VVX9 321 aa16.04■□□□□ 0.16
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF880Q6PDB4 577 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms