RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382723.4

MSX1-201, Transcript of msh homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSX1, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1-201ENST00000382723 LYG2Q86SG7 212 aa22.18■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 ZNF525Q8N782 197 aa22.18■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 FAHD2AQ96GK7 314 aa22.18■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 C9orf170A2RU37 121 aa22.18■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 CCNKO75909 580 aa22.18■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 CGB3P0DN86 165 aa22.18■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 CGB7P0DN87 165 aa22.18■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 PIGPP57054 158 aa22.18■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 LDLRAD3Q86YD5 345 aa22.18■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 CASTOR1Q8WTX7 329 aa22.18■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 RSRP1Q9BUV0 290 aa22.18■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa22.17■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa22.17■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 HSD17B6O14756 317 aa22.17■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 GNRHRP30968 328 aa22.17■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 ZNF273Q14593 569 aa22.17■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 TMEM155Q4W5P6 130 aa22.17■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 FAM185AQ8N0U4 392 aa22.17■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 CCL28Q9NRJ3 127 aa22.17■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 CLN8Q9UBY8 286 aa22.17■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 MIOXQ9UGB7 285 aa22.17■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 LINC00312Q9Y6C7 94 aa22.17■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 LUMP51884 338 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 HTD2P86397 168 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 CD276Q5ZPR3 534 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 TMEM200BQ69YZ2 307 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 SPICQ8N5J4 248 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 CORO2AQ92828 525 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 GNG12Q9UBI6 72 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 OR8U9P0C7N5 309 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 TRAPPC2P0DI81 140 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 TRAPPC2BP0DI82 140 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 CD83Q01151 205 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 DHODHQ02127 395 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 LPCAT3Q6P1A2 487 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 ZNF841Q6ZN19 808 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 NLRC3Q7RTR2 1065 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 OR8B3Q8NGG8 313 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 OR8U1Q8NH10 309 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 OR8B2Q96RD0 313 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 SLC2A9Q9NRM0 540 aa22.16■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 SLC9A3R2Q15599 337 aa22.15■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 OR11H7Q8NGC8 314 aa22.15■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 F2RL2O00254 374 aa22.14■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 WNT2P09544 360 aa22.14■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 AKAP6Q13023 2319 aa22.14■■□□□ 1.14
MSX1-201ENST00000382723 CCL3L1P16619 93 aa22.14■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 CXCL3P19876 107 aa22.14■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 RAB9BQ9NP90 201 aa22.14■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 PRR13Q9NZ81 148 aa22.14■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 KCNS2Q9ULS6 477 aa22.14■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 IGHV3-7P01780 117 aa22.13■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 LIN54Q6MZP7 749 aa22.13■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 SGPP2Q8IWX5 399 aa22.13■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 JPT1Q9UK76 154 aa22.13■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 RNF150Q9ULK6 438 aa22.13■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa22.13■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 GPR31O00270 319 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 SFT2D2O95562 160 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 CD34P28906 385 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 LOXL3P58215 753 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 ZNF787Q6DD87 383 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 ZNF714Q96N38 554 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 GPHA2Q96T91 129 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 TAS2R3Q9NYW6 316 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 MGAT4CQ9UBM8 478 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 LPAR3Q9UBY5 353 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 SULT1A3P0DMM9 295 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 SULT1A4P0DMN0 295 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 NFYBP25208 207 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 ERVFRD-1P60508 538 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 TOLLIPQ9H0E2 274 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa22.12■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 TNFSF12O43508 249 aa22.11■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 MMP23AO75900 390 aa22.11■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 ATP5J2P56134 94 aa22.11■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 MORN2Q502X0 79 aa22.11■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa22.11■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 LEAP2Q969E1 77 aa22.11■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 ST6GAL2Q96JF0 529 aa22.11■■□□□ 1.13
MSX1-201ENST00000382723 PHB2Q99623 299 aa22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms