RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 CT55Q8WUE5 264 aa5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZG16BQ96DA0 208 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNE3Q9Y6H6 103 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 METTL12A8MUP2 240 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TIAF1O95411 115 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 SPANXN4Q5MJ08 99 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM166AQ6J272 317 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZSR6 202 aa5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 ACOT4Q8N9L9 421 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4B1Q8NGF8 309 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 C20orf78Q9BR46 151 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 ORAI3Q9BRQ5 295 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5V1Q9UGF6 321 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 C15orf65H3BRN8 121 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CCL22O00626 93 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 SOX14O95416 240 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 GPANK1O95872 356 aa5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 NTSP30990 170 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 XGP55808 180 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 C20orf196Q8IYI0 205 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 Q8NA96 180 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 OR6K6Q8NGW6 343 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 STARD4Q96DR4 205 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 REEP1Q9H902 201 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 KMT2EQ8IZD2 1858 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CT45A6P0DMU7 189 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CT45A5P0DMU8 189 aa5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 GLIPR1P48060 266 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 RPEL1Q2QD12 228 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CT45A1Q5HYN5 189 aa5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf174Q8IYL3 243 aa5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 F8VWA3 439 aa5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 TNFSF9P41273 254 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 GNG4P50150 75 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM159AQ6UWV7 190 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC39A11Q8N1S5 342 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 APCDD1LQ8NCL9 501 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 HES4Q9HCC6 221 aa5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 CT45A10P0DMU9 189 aa5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 KIR2DS1Q14954 304 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.81□□□□□ -1.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 C2orf48Q96LS8 159 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 RASL11BQ9BPW5 248 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2D2Q9H210 308 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CDIP1Q9H305 208 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 NUDT3O95989 172 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CSN2P05814 226 aa5.8□□□□□ -1.48
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