RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM56Q96MV1 263 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RNF167Q9H6Y7 350 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM235A6NFC5 223 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SIGLEC5O15389 551 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CFHR2P36980 270 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SPCS2Q15005 226 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 RNLSQ5VYX0 342 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 GTSCR1Q86UQ5 136 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 SDSLQ96GA7 329 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ABHD14BQ96IU4 210 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM133Q9H2Q1 129 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 GPX5O75715 221 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 FABP1P07148 127 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 FXYD3Q14802 87 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MPV17LQ2QL34 196 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 ADTRPQ96IZ2 230 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 FBXL15Q9H469 300 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 NECAP2Q9NVZ3 263 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 NOTOA8MTQ0 251 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 NXPH3O95157 252 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 HTN3P15516 51 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 GNB3P16520 340 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 BPIFB3P59826 476 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf76Q3KRA6 126 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF626Q68DY1 528 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf35Q96D05 121 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SPIN2AQ99865 258 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CHIAQ9BZP6 476 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 NDUFB11Q9NX14 153 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PTTG2Q9NZH5 202 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0G2JLM5 398 aa3.69□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 ACY3Q96HD9 319 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SLC35E1Q96K37 410 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 FREM2Q5SZK8 3169 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0A6YYJ9 748 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SRRM5B3KS81 715 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
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