RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 TMED3Q9Y3Q3 217 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 LINC00862A6NCI5 91 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 SHISA9B4DS77 424 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 F2RP25116 425 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 GRNP28799 593 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 SSTR5P35346 364 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
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ACTB-201ENST00000331789 C6orf183Q5T699 404 aa14.94□□□□□ -0.02
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ACTB-201ENST00000331789 C15orf65H3BRN8 121 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 K7N7A8 449 aa14.92□□□□□ -0.02
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ACTB-201ENST00000331789 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.92□□□□□ -0.02
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ACTB-201ENST00000331789 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.91□□□□□ -0.02
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ACTB-201ENST00000331789 LTC4SQ16873 150 aa14.9□□□□□ -0.02
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ACTB-201ENST00000331789 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.9□□□□□ -0.02
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ACTB-201ENST00000331789 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 SPINT2O43291 252 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 GYPAP02724 150 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 CD3EP07766 207 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 NMBP08949 121 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 WNT2P09544 360 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 IRF2P14316 349 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 TNFRSF1AP19438 455 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-201ENST00000331789 ESCO2Q56NI9 601 aa14.89□□□□□ -0.03
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