RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299705.9

TMED3-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED3, Length 1,475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3-201ENST00000299705 HERPUD1Q15011 391 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 LTC4SQ16873 150 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 LHX4Q969G2 390 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 YPEL2Q96QA6 119 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 SRRQ9GZT4 340 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 TOLLIPQ9H0E2 274 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 GNG12Q9UBI6 72 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 RGS11O94810 467 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 BPIFB3P59826 476 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 MORN2Q502X0 79 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 IGSF11Q5DX21 431 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 GPR157Q5UAW9 335 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 Q8N402 240 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 PNKDQ8N490 385 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 OR5AP2Q8NGF4 316 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 OR52L2PQ8NGH6 319 aa14.69□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 HSPA12AO43301 675 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 IGHV1-69P01742 117 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 FCER2P06734 321 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 HNF1AP20823 631 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 TAS2R46P59540 309 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 ARPC4P59998 168 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 KLRD1Q13241 179 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 OR9G1Q8NH87 305 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 NECAP2Q9NVZ3 263 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 TAS2R8Q9NYW2 309 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.68□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 COX7A1P24310 79 aa14.67□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 CEACAM6P40199 344 aa14.67□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 PRRX1P54821 245 aa14.67□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 GNMTQ14749 295 aa14.67□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 ZNF626Q68DY1 528 aa14.67□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 TMEM229BQ8NBD8 167 aa14.67□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 BEND2Q8NDZ0 799 aa14.67□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 ZNF596Q8TC21 504 aa14.67□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.67□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 PSG11Q9UQ72 335 aa14.67□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 FAM172BPA6NC97 362 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 ODF3BA8MYP8 253 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 J3QR06 171 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 ITGB1BP1O14713 200 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 BET1O15155 118 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 IGLV1-47P01700 117 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 CSF1P09603 554 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 TBPP20226 339 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 OR3A3P47888 321 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 CDK10Q15131 360 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 ACTBL2Q562R1 376 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 UTF1Q5T230 341 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 OVCH2Q7RTZ1 564 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 LINC00311Q8N616 119 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 TRIM63Q969Q1 353 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 NUP50Q9UKX7 468 aa14.66□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 TOR1AO14656 332 aa14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 LANCL1O43813 399 aa14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 HLA-DMAP28067 261 aa14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 TAS2R19P59542 299 aa14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 MIDNQ504T8 468 aa14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 PDZD9Q8IXQ8 264 aa14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 FAM216AQ8WUB2 273 aa14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 LEAP2Q969E1 77 aa14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 GINS4Q9BRT9 223 aa14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.65□□□□□ -0.06
TMED3-201ENST00000299705 NPFFO15130 113 aa14.64□□□□□ -0.07
TMED3-201ENST00000299705 CD74P04233 296 aa14.64□□□□□ -0.07
TMED3-201ENST00000299705 ARG1P05089 322 aa14.64□□□□□ -0.07
TMED3-201ENST00000299705 OR5H8P0DN80 308 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms