RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 PRR19A6NJB7 356 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 C1QL2Q7Z5L3 287 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 GPHA2Q96T91 129 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TTTY12Q9BZ98 90 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 FZR1Q9UM11 496 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 HOXA5P20719 270 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 MED13LQ71F56 2210 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 DDA1Q9BW61 102 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 MSL2Q9HCI7 577 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 A0A0U1RQV5 110 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 SSX7Q7RTT5 188 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM230Q96A57 120 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 ACP1P24666 158 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 HOXA6P31267 233 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 REC114Q7Z4M0 266 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 LRP11Q86VZ4 500 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 NGBQ9NPG2 151 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 C20orf202A1L168 122 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 RAMP1O60894 148 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 RNF224P0DH78 156 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 MPDZO75970 2070 aa14.77□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 ESPL1Q14674 2120 aa14.77□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.77□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.77□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.77□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 RPH3ALQ9UNE2 315 aa14.77□□□□□ -0.04
TRPC1-201ENST00000273482 PMCHP20382 165 aa14.77□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 ERVFC1-1P60608 527 aa14.77□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 FOXO1Q12778 655 aa14.77□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM187Q14656 261 aa14.77□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 OR8B8Q15620 311 aa14.77□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.77□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 SPINK4O60575 86 aa14.77□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 GLIPR1P48060 266 aa14.77□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 GNG3P63215 75 aa14.77□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CD5P06127 495 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CEACAM6P40199 344 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 GINS3Q9BRX5 216 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 RFPL3SP0C7P2 107 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 MZT1Q08AG7 82 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 OR1K1Q8NGR3 316 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 SLC35D1Q9NTN3 355 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 TUBD1Q9UJT1 453 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 TECTAO75443 2155 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF83P51522 516 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 ANAPC16Q96DE5 110 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 RAB9BQ9NP90 201 aa14.76□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 FCN1O00602 326 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 PAGE4O60829 102 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CA6P23280 308 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 MOB3AQ96BX8 217 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 GALMQ96C23 342 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 C11orf94C9JXX5 98 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 OR7C2O60412 319 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 UMODP07911 640 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 OR1P1Q8NH06 330 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM147Q9BVK8 224 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CADP27708 2225 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 CRISP2P16562 243 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 VAMP3Q15836 100 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 SPINK9Q5DT21 86 aa14.75□□□□□ -0.05
TRPC1-201ENST00000273482 Q96M66 194 aa14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms