RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.01□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 ZAR1Q86SH2 424 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 STXBP6Q8NFX7 210 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 CYR61O00622 381 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 CCR5P51681 352 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 C10orf113Q5VZT2 155 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 PERPQ96FX8 193 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 FBLN7Q53RD9 439 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 DERL1Q9BUN8 251 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 TINAGQ9UJW2 476 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 F5H697 171 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 H0Y980 276 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 TMEM250H0YL14 139 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 DLEU1O43261 78 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 SMIM13P0DJ93 91 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 SFRP2Q96HF1 295 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 NUDT3O95989 172 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 CBLN1P23435 193 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 CCL11P51671 97 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 TMEM45BQ96B21 275 aa14□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 EVPLQ92817 2033 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 UPK3AO75631 287 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 SRFP11831 508 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 WDYHV1Q96HA8 205 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 CADM4Q8NFZ8 388 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 MRGPRX1Q96LB2 322 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 VSTM2LQ96N03 204 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 MPDU1O75352 247 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 VENTXO95231 258 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 BGLAPP02818 100 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 NPY1RP25929 384 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 BTCP35070 178 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 METAP1P53582 386 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 MMD2Q8IY49 270 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 OR10D3Q8NH80 312 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 HIST1H4GQ99525 98 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 M0R3E3 92 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 HIST1H2BKO60814 126 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 RAMP1O60894 148 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 HIST1H2BJP06899 126 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 HIST1H2BOP23527 126 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 CD27P26842 260 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 HIST1H2BBP33778 126 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 HIST1H2BDP58876 126 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 HIST1H2BCP62807 126 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 HIST2H2BEQ16778 126 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 OR4X1Q8NH49 305 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 HIST1H2BHQ93079 126 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 HIST1H2BNQ99877 126 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 HIST1H2BMQ99879 126 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 MPC1Q9Y5U8 109 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 DNPH1O43598 174 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 LINC00614P0C842 121 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 EMP1P54849 157 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 DOT1LQ8TEK3 1739 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 COLCA2A8K830 154 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 NUDT11Q96G61 164 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 TMEM70Q9BUB7 260 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 OOEPA6NGQ2 149 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 MAS1LP35410 378 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 PRRX1P54821 245 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 SLC23A3Q6PIS1 610 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 GBGT1Q8N5D6 347 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 OR1L1Q8NH94 360 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 OR8B2Q96RD0 313 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 HES7Q9BYE0 225 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 TTC3P53804 2025 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 A1L4Q6 167 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 PATE4P0C8F1 98 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 PQLC2Q6ZP29 291 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 NPVFQ9HCQ7 196 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 SDK1Q7Z5N4 2213 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 WNT5AP41221 380 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 WFDC6Q9BQY6 131 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 PCM1Q15154 2024 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PP11 408 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 A6NNC1 897 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 ARF6P62330 175 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 RPL30P62888 115 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 FUT5Q11128 374 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-201ENST00000256413 LRP5O75197 1615 aa13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms