RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636280.1

DNM1-222, Transcript of dynamin 1, human

TSL 5

Gene DNM1, Length 2,462 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-222	ENST00000636280	KIRREL1	Q96J84	757 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	ITPR1	Q14643	2758 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280		A0A1B0GW55	424 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	IFNL4	K9M1U5	179 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	ADAP1	O75689	374 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	SPDEF	O95238	335 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	RLN2	P04090	185 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	SERPINF1	P36955	418 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	GATA4	P43694	442 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	COL10A1	Q03692	680 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	CD177	Q8N6Q3	437 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	DUX4	Q9UBX2	424 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	PCDHB10	Q9UN67	800 aa		13.38	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	ROS1	P08922	2347 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	CDSN	Q15517	529 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	MFF	Q9GZY8	342 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	IL19	Q9UHD0	177 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	RELN	P78509	3460 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	C5orf51	A6NDU8	294 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	SIGLEC5	O15389	551 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	PSG2	P11465	335 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	RPA2	P15927	270 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	GNRHR	P30968	328 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	OR3A1	P47881	315 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	AES	Q08117	197 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	FAM122A	Q96E09	287 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	NAA60	Q9H7X0	242 aa		13.37	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	SHISA9	B4DS77	424 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	LHB	P01229	141 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	PRDX2	P32119	198 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	KCNJ3	P48549	501 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	FGL1	Q08830	312 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	PRR18	Q8N4B5	295 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	LINC01560	Q8TB33	94 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	COQ2	Q96H96	371 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	GCM1	Q9NP62	436 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	TNFSF4	P23510	183 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	SP6	Q3SY56	376 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	UBALD1	Q8TB05	177 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		13.36	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	OR5AC1	P0C628	307 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	ARHGDIB	P52566	201 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	GALNT14	Q96FL9	552 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	CACNA1D	Q01668	2161 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280		H7C2Y5	167 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	HMGN3	Q15651	99 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	FAM201A	Q5SY85	155 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		13.35	□□□□□ -0.27
DNM1-222	ENST00000636280	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27

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