RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 PMP2P02689 132 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 LIPFP07098 398 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF735P0CB33 412 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 HRH1P35367 487 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 KIR2DS4P43632 304 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 LOXL3P58215 753 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 GNMTQ14749 295 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 KIR2DS1Q14954 304 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 TRAT1Q6PIZ9 186 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 PRR18Q8N4B5 295 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 OR4A4PQ8NGN8 299 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 KCNIP1Q9NZI2 227 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 OR1A1Q9P1Q5 309 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 TBC1D24Q9ULP9 559 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 MGAT4AQ9UM21 535 aa17.16■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 ENSAO43768 121 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 HEXAP06865 529 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 MSMBP08118 114 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 CSF1P09603 554 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 RFX2P48378 723 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 FAAP20Q6NZ36 180 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 HEPN1Q6WQI6 88 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 OR52L2PQ8NGH6 319 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 OR4C16Q8NGL9 310 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 BORCS5Q969J3 196 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 SIRPDQ9H106 197 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 INSIG2Q9Y5U4 225 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 MYO9AB2RTY4 2548 aa17.15■□□□□ 0.34
CSAG3-202ENST00000617158 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 B4DSR2 109 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 MMP9P14780 707 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 TAS2R19P59542 299 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 ARF6P62330 175 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 PAX8Q06710 450 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP1-1Q07627 177 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 CDK10Q15131 360 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 LTC4SQ16873 150 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 TRIQKQ629K1 86 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 STEAP1BQ6NZ63 245 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 OVCH2Q7RTZ1 564 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 LDLRAD3Q86YD5 345 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 LINC01356Q8N9X3 169 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 DMRTB1Q96MA1 342 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 SLC6A7Q99884 636 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 HRASLSQ9HDD0 168 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 NOTCH2Q04721 2471 aa17.14■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 SPINT2O43291 252 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV3-43DP0DP04 118 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 FPR2P25090 351 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 HTD2P86397 168 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 CHRFAM7AQ494W8 412 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 VAX1Q5SQQ9 334 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 HCP5Q6MZN7 132 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 TOMM5Q8N4H5 51 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 KIR3DL3Q8N743 410 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 IL1F10Q8WWZ1 152 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 COX4I2Q96KJ9 171 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 TOLLIPQ9H0E2 274 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 TAS2R8Q9NYW2 309 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 ONECUT1Q9UBC0 465 aa17.13■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP17.12■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 M0R1W7 72 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 RAB3DO95716 219 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 IGHV1-8P0DP01 117 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 BTCP35070 178 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 DYRK1AQ13627 763 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 OR5H2Q8NGV7 314 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 OR56B4Q8NH76 319 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 LEAP2Q969E1 77 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 GALMQ96C23 342 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 GFOD1Q9NXC2 390 aa17.12■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 BET1O15155 118 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 TUSC2O75896 110 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 DIRAS3O95661 229 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 RBP4P02753 201 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 AKAIN1P0CW23 69 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 OR5H8P0DN80 308 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 TBPP20226 339 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 TAS2R46P59540 309 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 ARPC4P59998 168 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 OR10A7Q8NGE5 316 aa17.11■□□□□ 0.33
CSAG3-202ENST00000617158 TNFRSF14Q92956 283 aa17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.4 ms