RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 CLN8Q9UBY8 286 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 TINAGQ9UJW2 476 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 MMP9P14780 707 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 ZNF519Q8TB69 540 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 PIPOXQ9P0Z9 390 aa10.45□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 CLDN18P56856 261 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 C9orf40Q8IXQ3 194 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 RAB1CQ92928 201 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 IL17BQ9UHF5 180 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 A0A1W2PPC1 479 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 MFSD2BA6NFX1 497 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 NAT2P11245 290 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 MMP16P51512 607 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 RBM11P57052 281 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 LDLRAD3Q86YD5 345 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 RFLNBQ8N5W9 214 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 MYOZ3Q8TDC0 251 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 PGLYRP3Q96LB9 341 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 UCN2Q96RP3 112 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 TCFL5Q9UL49 500 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 OR51B2Q9Y5P1 312 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 RHBDL1O75783 438 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 FCGR3AP08637 254 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 NPY1RP25929 384 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 OR5R1Q8NH85 324 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 ZNF721Q8TF20 911 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 Q8WTZ3 238 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 DIRC3C9JPN6 131 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 EML2O95834 649 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 CCL3P10147 92 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 OR5AC2Q9NZP5 309 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 IFITM10A6NMD0 228 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 SYNGR1O43759 233 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 CD3EP07766 207 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 WNT5AP41221 380 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 ZP4Q12836 540 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 HIKESHIQ53FT3 197 aa10.44□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 CA11O75493 328 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 MGPP08493 103 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 LIFP15018 202 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 SPEM2Q0P670 501 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 SLC25A40Q8TBP6 338 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 ABHD3Q8WU67 409 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 TBX15Q96SF7 602 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 NRIP2Q9BQI9 281 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 A0A1W2PRD5 423 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 A0A1W2PRF3 423 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 A0A1W2PRM7 423 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 BCL2P10415 239 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 FSTP19883 344 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 GBGT1Q8N5D6 347 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 LRRC75AQ8NAA5 344 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 DEFB124Q8NES8 71 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 STXBP6Q8NFX7 210 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 HARBI1Q96MB7 349 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 TMEM208Q9BTX3 173 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 FSCN3Q9NQT6 498 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 CD40P25942 277 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 PAFAH1B2P68402 229 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 VAX1Q5SQQ9 334 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 TMEM204Q9BSN7 226 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 IGKV1D-16P01601 117 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 RNF224P0DH78 156 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 AESQ08117 197 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 DTX4Q9Y2E6 619 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 MIA3Q5JRA6 1907 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 TRAV39A0A0B4J263 110 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 C1QCP02747 245 aa10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 QSER1Q2KHR3 1735 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 H3BVH4 76 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 COL10A1Q03692 680 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 GUCA2BQ16661 112 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 TMEM52Q8NDY8 209 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 SMIM12Q96EX1 92 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 PRSS27Q9BQR3 290 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 M0R296 226 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 BRS3P32247 399 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 ZNF137PP52743 207 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 GHITMQ9H3K2 345 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 ZNF98A6NK75 572 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 J3KRW8 73 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 GAB4Q2WGN9 574 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 HES3Q5TGS1 186 aa10.42□□□□□ -0.74
TNS1-220ENST00000611415 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms