RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 PLXNB1O43157 2135 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 SPINT2O43291 252 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 OPN1MWP04001 364 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 UCHL1P09936 223 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 OPN1MW2P0DN77 364 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 OPN1MW3P0DN78 364 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 CRHBPP24387 322 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 HSPA13P48723 471 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM95Q3KNT9 176 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 ABCA11PQ4W5N1 156 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 HSD17B12Q53GQ0 312 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 C6orf183Q5T699 404 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 LIPKQ5VXJ0 399 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 TRAT1Q6PIZ9 186 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 DRAM1Q8N682 238 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 OR56B4Q8NH76 319 aa16.09■□□□□ 0.17
GIPC1-211ENST00000589631 A0A1W2PPE3 182 aa16.08■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 C12orf77C9JDV5 145 aa16.08■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 PDCD6O75340 191 aa16.08■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 LPLP06858 475 aa16.08■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 VHLP40337 213 aa16.08■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 TRAM1Q15629 374 aa16.08■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 PRSS48Q7RTY5 328 aa16.08■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 OR4K15Q8NH41 348 aa16.08■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 MOB4Q9Y3A3 225 aa16.08■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 HSD17B6O14756 317 aa16.07■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 VSIG8P0DPA2 414 aa16.07■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 IZUMO2Q6UXV1 221 aa16.07■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF554Q86TJ5 538 aa16.07■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 OR5AU1Q8NGC0 362 aa16.07■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 UBALD1Q8TB05 177 aa16.07■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa16.07■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 FAM46BQ96A09 425 aa16.07■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 UBE2QL1A1L167 161 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 ERICH4A6NGS2 130 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 CCRL2O00421 344 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 SLC22A1O15245 554 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 MPIG6BO95866 241 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 HBZP02008 142 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 HSMCR30P0CW71 290 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 CPEP16870 476 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 HTR2CP28335 458 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 CD83Q01151 205 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 EBI3Q14213 229 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 STEAP3Q658P3 488 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM91Q6ZNR0 172 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 LYG1Q8N1E2 194 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 KCNG3Q8TAE7 436 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM203Q969S6 136 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC90BQ9GZT6 254 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 CMYA5Q8N3K9 4069 aa16.06■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 FGF16O43320 207 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 IGHV3-43DP0DP04 118 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM11P17152 192 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 IL3RAP26951 378 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 HES1Q14469 280 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF439Q8NDP4 499 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 OR4F17Q8NGA8 305 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 OR6M1Q8NGM8 313 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 NEDD4LQ96PU5 975 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 OR4F4Q96R69 305 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 MGLLQ99685 303 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 TM2D1Q9BX74 207 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM59Q9BXS4 323 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 TAF9BQ9HBM6 251 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 KCNIP1Q9NZI2 227 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 GNG12Q9UBI6 72 aa16.05■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 ARL6IP5O75915 188 aa16.04■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 IGKV1D-33P01593 117 aa16.04■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 IGKV1-33P01594 117 aa16.04■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 CHATP28329 748 aa16.04■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF137PP52743 207 aa16.04■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 QRFPP83859 136 aa16.04■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 OR10K2Q6IF99 312 aa16.04■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 MOB3BQ86TA1 216 aa16.04■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 C5orf56Q8N8D9 126 aa16.04■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 OR1L1Q8NH94 360 aa16.04■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 LRRC42Q9Y546 428 aa16.04■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM14DPA8MWL7 114 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms