RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR13Q9NZ81 148 aa21.51■■□□□ 1.03
CAPNS1-204ENST00000587718 E5RGE8 158 aa21.5■■□□□ 1.03
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CAPNS1-204ENST00000587718 DUSP1P28562 367 aa21.5■■□□□ 1.03
CAPNS1-204ENST00000587718 FXYD4P59646 89 aa21.5■■□□□ 1.03
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CAPNS1-204ENST00000587718 WDR31Q8NA23 367 aa21.44■■□□□ 1.02
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CAPNS1-204ENST00000587718 OR2J1Q9GZK6 312 aa21.44■■□□□ 1.02
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