RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 PROB1E7EW31 1015 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TUSC2O75896 110 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TK1P04183 234 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 UCP3P55916 312 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6ZS49 121 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR8G5Q8NG78 346 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLCE1Q9P212 2302 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ROS1P08922 2347 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 NKX2-6A6NCS4 301 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 A6NLC8 198 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 M0R1B8 84 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ASCL1P50553 236 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM27E3Q08E93 113 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 IL13RA2Q14627 380 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 VHLLQ6RSH7 139 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ERGIC1Q969X5 290 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLK3Q9H4B4 646 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DUSP13Q9UII6 198 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 WASF3Q9UPY6 502 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM157CP0CG43 387 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 MST1LQ2TV78 715 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF880Q6PDB4 577 aa8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 K7EPK0 472 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DEDDO75618 318 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 IFNA21P01568 189 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 BMP5P22003 454 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 HLA-DRB3P79483 266 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 NAAAQ02083 359 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q8NA96 180 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 AQP10Q96PS8 301 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 AMDHD2Q9Y303 409 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 H7C1Q1 480 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 J3QW42 95 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 HAND1O96004 215 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGLV2-14P01704 120 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 AESQ08117 197 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 WDR82Q6UXN9 313 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR51H1Q8NH63 302 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 STOML3Q8TAV4 291 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 SUCNR1Q9BXA5 334 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TLNRD1Q9H1K6 362 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPACA1Q9HBV2 294 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.56□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TOR1AO14656 332 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 FGF16O43320 207 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 EGR1P18146 543 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIR2DS4P43632 304 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 LPAR6P43657 344 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIR2DS1Q14954 304 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF146Q15072 292 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 P2RY6Q15077 328 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TESK1Q15569 626 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00596Q86U02 117 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 LGI3Q8N145 548 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 LRTM2Q8N967 370 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR2Z1Q8NG97 314 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 BOD1Q96IK1 185 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRRX2Q99811 253 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 SYT3Q9BQG1 590 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 RFNGQ9Y644 331 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A0G2JRQ6 117 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM218A2RU14 115 aa8.55□□□□□ -1.04
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