RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 PLA2G10O15496 165 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 PRODHO43272 600 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 MPZL2O60487 215 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 RHBDL1O75783 438 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 TFF1P04155 84 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 HCKP08631 526 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 H2BFMP0C1H6 154 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 ALOX5APP20292 161 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 GLRA1P23415 457 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 CHRNA7P36544 502 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 MAP2K4P45985 399 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 CCR9P51686 369 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 DLX6P56179 175 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 RAP2BP61225 183 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 GNG3P63215 75 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 P2RY14Q15391 338 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 HAGHQ16775 308 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 PYDC2Q56P42 97 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 MZT2AQ6P582 158 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 Q6ZSR3 168 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 CALHM1Q8IU99 346 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 POC1AQ8NBT0 407 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 OR2T29Q8NH02 315 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 MED20Q9H944 212 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 ZNF702PQ9H963 129 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 FAM206AQ9NX38 181 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 GHRLQ9UBU3 117 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.8□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 A0A1W2PPQ1 181 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 FAM183AA6NL82 134 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 PIN1P1O15428 100 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 HSPA12AO43301 675 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 ANGPTL7O43827 346 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 XPNPEP2O43895 674 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 MED6O75586 246 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 BPNT1O95861 308 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 RBP4P02753 201 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 UBBP0CG47 229 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 PGA5P0DJD9 388 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 NDUFB7P17568 137 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 SLC2A5P22732 501 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 MPZP25189 248 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 S100A2P29034 98 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 DDTP30046 118 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 SLC6A1P30531 599 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 MNDAP41218 407 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 GPM6AP51674 278 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 DYNLT3P51808 116 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 ROM1Q03395 351 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 SNAPC1Q16533 368 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 RNLSQ5VYX0 342 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 TMEM42Q69YG0 159 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 MKXQ8IYA7 352 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 PXT1Q8NFP0 134 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 RAB3CQ96E17 227 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 DIRAS2Q96HU8 199 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 OR51J1Q9H342 316 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 REEP1Q9H902 201 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 HES4Q9HCC6 221 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 TCF19Q9Y242 345 aa6.79□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.78□□□□□ -1.32
PALB2-202ENST00000561514 A0A1W2PPH5 198 aa6.78□□□□□ -1.32
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