RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 CTDSPLO15194 276 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 GSTT2P0CG29 244 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 GSTT2BP0CG30 244 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGHV1-8P0DP01 117 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 CBX5P45973 191 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 UTF1Q5T230 341 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 HEPN1Q6WQI6 88 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 LINC00299Q6ZSB3 139 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 VMO1Q7Z5L0 202 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF554Q86TJ5 538 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 HOGA1Q86XE5 327 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIRREL1Q96J84 757 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF286AQ9HBT8 521 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 KLK11Q9UBX7 282 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNS2Q9ULS6 477 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 MGAT4AQ9UM21 535 aa15.29■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 GABARAPH6UMI1 98 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPINT2O43291 252 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 RBP4P02753 201 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGHV3-43DP0DP04 118 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 PYDC2Q56P42 97 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR52W1Q6IF63 320 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 Q6ZS49 121 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 MFSD4AQ8N468 514 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 BEST4Q8NFU0 473 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 FCAMRQ8WWV6 532 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SNAPC3Q92966 411 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 AKIP1Q9NQ31 210 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 IFT46Q9NQC8 304 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 YAE1D1Q9NRH1 226 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANAPC10Q9UM13 185 aa15.28■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SONP18583 2426 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A1W2PPE2 198 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A1W2PR64 198 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 A0A1W2PRV1 198 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM172BPA6NC97 362 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 J3QLI3 93 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 F2RL2O00254 374 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 FABP7O15540 132 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRTN3P24158 256 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 NFYBP25208 207 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMIM4Q8WVI0 70 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 IL1F10Q8WWZ1 152 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 TNFRSF14Q92956 283 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SRRQ9GZT4 340 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 SESN1Q9Y6P5 492 aa15.27■□□□□ 0.04
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 FPR2P25090 351 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIR2DS4P43632 304 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 KLRD1Q13241 179 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 KIR2DS1Q14954 304 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 HERPUD1Q15011 391 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGSF11Q5DX21 431 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 CLEC9AQ6UXN8 241 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR52L2PQ8NGH6 319 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 UPRTQ96BW1 309 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 GALMQ96C23 342 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 SUCNR1Q9BXA5 334 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTFP1Q9UDX5 166 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 LANCL1O43813 399 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 RBBP9O75884 186 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 IGHV3-7P01780 117 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 NAT1P18440 290 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 LOXL3P58215 753 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF45Q02386 682 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 GNMTQ14749 295 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 HCP5Q6MZN7 132 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDZD9Q8IXQ8 264 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR10A7Q8NGE5 316 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR4A4PQ8NGN8 299 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 LEAP2Q969E1 77 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 LHX4Q969G2 390 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM133Q9H2Q1 129 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 RAB9BQ9NP90 201 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANXA10Q9UJ72 324 aa15.26■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 A8MV72 311 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 COX7A1P24310 79 aa15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 RCVRNP35243 200 aa15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 HTD2P86397 168 aa15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 Q71RC1 249 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 LYSMD2Q8IV50 215 aa15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 Q8N402 240 aa15.25■□□□□ 0.03
USP3-AS1-203ENST00000559737 OR10V1Q8NGI7 309 aa15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms