RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558065.1

SEMA4B-204, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEMA4B, Length 3,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-204ENST00000558065 BCL2L10Q9HD36 194 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.5□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 KBTBD11O94819 623 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 SPTBP11277 2137 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 TMPRSS3P57727 454 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 Q7L0L9 218 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 FAM58AQ8N1B3 248 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 PRR31Q5SQ13 230 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 PFN4Q8NHR9 129 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF732B4DXR9 585 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 PLPP3O14495 311 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ABHD16AO95870 558 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC25A6P12236 298 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF117Q03924 483 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 LCN12Q6JVE5 192 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 CSNK1A1LQ8N752 337 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM171Q8WVE6 324 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 DUSP23Q9BVJ7 150 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.49□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A0J9YY10 115 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 A0A1B0GX78 115 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 SIRPB1O00241 398 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 P2RY10O00398 339 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 CLDN7O95471 211 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 PRSS27Q9BQR3 290 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 GCM1Q9NP62 436 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 VWC2LB2RUY7 222 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 KLK1P06870 262 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ADH4P08319 380 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ADH5P11766 374 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 SRD5A2P31213 254 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 PMCHL1Q16048 86 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 CDKN3Q16667 212 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 STUMQ69YW2 141 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 BAGE3Q86Y29 109 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 BAGE2Q86Y30 109 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 OR52E5Q8NH55 327 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 TMEM204Q9BSN7 226 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 C1orf123Q9NWV4 160 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 CACNA1CQ13936 2221 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 REG1AP05451 166 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 GRPRP30550 384 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 GPM6AP51674 278 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 RPL24P83731 157 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 LHFPL1Q86WI0 220 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 LGI3Q8N145 548 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ULBP3Q9BZM4 244 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 NGBQ9NPG2 151 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa9.48□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 MEGF11A6BM72 1044 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF728P0DKX0 622 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 FKBP1BP68106 108 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 SDF2Q99470 211 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 IL23AQ9NPF7 189 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 CLDND1Q9NY35 253 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 PTGESO14684 152 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 WIPF1O43516 503 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 TBL1XO60907 577 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 CA2P00918 260 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 KRASP01116 189 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 RGRP47804 291 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 FUT6P51993 359 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ALG10Q5BKT4 473 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 AMELYQ99218 206 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 JKAMPQ9P055 326 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 CLCF1Q9UBD9 225 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 FBLN5Q9UBX5 448 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 MLNRO43193 412 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 TGFAP01135 160 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 SRFP11831 508 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 IGFBP2P18065 325 aa9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SEMA4B-204ENST00000558065 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms