RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CEACAM3P40198 252 aa15.52■□□□□ 0.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM95Q3KNT9 176 aa15.52■□□□□ 0.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABHD12Q8N2K0 398 aa15.52■□□□□ 0.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AKR1E2Q96JD6 320 aa15.52■□□□□ 0.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SELENOIQ9C0D9 397 aa15.52■□□□□ 0.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR51E2Q9H255 320 aa15.52■□□□□ 0.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DPM3Q9P2X0 92 aa15.52■□□□□ 0.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PRX2 142 aa15.51■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLL1P15814 213 aa15.51■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MGMTP16455 207 aa15.51■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NFYBP25208 207 aa15.51■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BRS3P32247 399 aa15.51■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 QRFPP83859 136 aa15.51■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C22orf42Q6IC83 251 aa15.51■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM104Q8NE00 496 aa15.51■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR6M1Q8NGM8 313 aa15.51■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CAPSLQ8WWF8 208 aa15.51■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 YIPF6Q96EC8 236 aa15.51■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LIN7BQ9HAP6 207 aa15.51■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CALYQ9NYX4 217 aa15.51■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa15.5■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC17A2O00624 439 aa15.5■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PF4V1P10720 104 aa15.5■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD36P16671 472 aa15.5■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GZMHP20718 246 aa15.5■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HTR2CP28335 458 aa15.5■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PSMD7P51665 324 aa15.5■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR10A7Q8NGE5 316 aa15.5■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR4P4Q8NGL7 312 aa15.5■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BANF2Q9H503 90 aa15.5■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VCX3AQ9NNX9 186 aa15.5■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF581Q9P0T4 197 aa15.5■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM14DPA8MWL7 114 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LEUTXA8MZ59 168 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CA11O75493 328 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MMP23AO75900 390 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL1AP01583 271 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GLAP06280 429 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VSIG8P0DPA2 414 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GADD45AP24522 165 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD34P28906 385 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB12Q6IQ22 244 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NR2C2APQ86WQ0 139 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCNG3Q8TAE7 436 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MRGPRDQ8TDS7 321 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q96M66 194 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLGRKTQ9HBL7 147 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SSR3Q9UNL2 185 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 V9GY05 133 aa15.49■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AIPO00170 330 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MPIG6BO95866 241 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FUT3P21217 361 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 UNC119Q13432 240 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR13A1Q8NGR1 328 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR9G1Q8NH87 305 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM46BQ96A09 425 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NEDD4LQ96PU5 975 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ETAA1Q9NY74 926 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAH9Q9NYC9 4486 aa15.48■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COL7A1Q02388 2944 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A087X0M5 115 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1B0GX30 115 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LDLRAD4O15165 306 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BPNT1O95861 308 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PF4P02776 101 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYL9P24844 172 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CD24P25063 80 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR10A3P58181 314 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C17orf58Q2M2W7 97 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C6orf183Q5T699 404 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SIGIRRQ6IA17 410 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIRREL1Q96J84 757 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM59Q9BXS4 323 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LINC00574Q9H8X3 128 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.47■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM172BPA6NC97 362 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OOSP1A8MZH6 123 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDCD5O14737 125 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDCD6O75340 191 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR2F2O95006 317 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IGLV1-47P01700 117 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LPLP06858 475 aa15.46■□□□□ 0.07
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB3BP20337 219 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms