RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 M0R1W7 72 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 NEURL1O76050 574 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 CDKN1AP38936 164 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 LYZP61626 148 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM18Q96B42 140 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 ABHD1Q96SE0 405 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 HRKO00198 91 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 HRH4Q9H3N8 390 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 ASPDHA6ND91 283 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 OR5T1Q8NG75 326 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 IL17DQ8TAD2 202 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 GIMAP1Q8WWP7 306 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 H0Y980 276 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 ETV1P50549 477 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 SPACA5Q96QH8 159 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 VSIG4Q9Y279 399 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 M0QYG6 137 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 FXYD1O00168 92 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 ARPC5O15511 151 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 TRGV3P03979 118 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 FGF7P21781 194 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 OR5B3Q8NH48 314 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.92□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.91□□□□□ -1.3
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PTPRB-209ENST00000550857 F5H697 171 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 EREGO14944 169 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 PPP1R2P9O14990 202 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV1-2P23083 117 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-209ENST00000550857 FRZBQ92765 325 aa6.91□□□□□ -1.3
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