RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB108AA8MXU0 73 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 CRISP2P16562 243 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 CSRP3P50461 194 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC25A45Q8N413 288 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 VAMP8Q9BV40 100 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRB-208ENST00000550358 H3BMH7 237 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 CHST1O43916 411 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 S1PR2O95136 353 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 RECKO95980 971 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 STAG3L2P0CL84 134 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 MPV17P39210 176 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 PATE3B3GLJ2 98 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRB-208ENST00000550358 M0R143 59 aa7.37□□□□□ -1.23
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