RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547374.5

BRF1-210, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 5

Gene BRF1, Length 3,809 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-210	ENST00000547374	SAP25	Q8TEE9	199 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	GPR146	Q96CH1	333 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CST2	P09228	141 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	AGA	P20933	346 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	MAGEA5	P43359	124 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	FAM210B	Q96KR6	192 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	FAM157A	C9JC47	383 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	SSX3	Q99909	188 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	WASF3	Q9UPY6	502 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	UBE2C	O00762	179 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	NXPH2	O95156	264 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	LINC00205	P59089	165 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	HLA-DRB3	P79483	266 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	RTP5	Q14D33	572 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	PYY3	Q5JQD4	70 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CARF	Q8N187	725 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	FRZB	Q92765	325 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CD55	P08174	381 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	APLNR	P35414	380 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	TGFBR3	Q03167	851 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	HERPUD1	Q15011	391 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	ADGRG7	Q96K78	797 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	OR51M1	Q9H341	326 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CDIPT	O14735	213 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CTSS	P25774	331 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	KIR2DS4	P43632	304 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	KIR2DS1	Q14954	304 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CST9LP1	Q5W188	147 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	COMMD1	Q8N668	190 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CDS2	O95674	445 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	TRGC1	P0CF51	173 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	SRD5A2	P31213	254 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CEACAM6	P40199	344 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	SRPX	P78539	464 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	BAX	Q07812	192 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CLN3	Q13286	438 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	ICAM4	Q14773	271 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374		Q6ZRM9	215 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	OR4F5	Q8NH21	305 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	APH1A	Q96BI3	265 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	HINT2	Q9BX68	163 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	GAMT	Q14353	236 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	EDDM3A	Q14507	147 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	POM121	Q96HA1	1249 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374		Q9N2K0	584 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	MED13L	Q71F56	2210 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	ZNF716	A6NP11	495 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	F2R	P25116	425 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	ATP5S	Q99766	215 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	KIAA1456	Q9P272	454 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CLN8	Q9UBY8	286 aa		11.1	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	PITX3	O75364	302 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	IL2RG	P31785	369 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	CHRNA7	P36544	502 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	ARG2	P78540	354 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BRF1-210	ENST00000547374	ELOB	Q15370	118 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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