RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544432.5

VAMP1-208, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, human

TSL 3

Gene VAMP1, Length 759 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAMP1-208	ENST00000544432	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432		A0A1W2PPI3	338 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	TSPAN15	O95858	294 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	IGHV3-7	P01780	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	GNG10	P50151	68 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	QRFP	P83859	136 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	MGLL	Q99685	303 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	CCRL2	O00421	344 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	PEX14	O75381	377 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	FBXO24	O75426	580 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	ARL6IP5	O75915	188 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	ATP6V1G2	O95670	118 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	BPNT1	O95861	308 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	MPIG6B	O95866	241 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	AMY1A	P04745	511 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	AMY2A	P04746	511 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	HSMCR30	P0CW71	290 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	CHAT	P28329	748 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	HTR2C	P28335	458 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	VHL	P40337	213 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	RANBP1	P43487	201 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	STEAP3	Q658P3	488 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	DRAM1	Q8N682	238 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	TMEM203	Q969S6	136 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	FAM46B	Q96A09	425 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	CNBD2	Q96M20	576 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	TM2D1	Q9BX74	207 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	LRRC42	Q9Y546	428 aa		11.1	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	UBE2QL1	A1L167	161 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	HBZ	P02008	142 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	IL3RA	P26951	378 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	ZNF137P	P52743	207 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	EBI3	Q14213	229 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	OR4K15	Q8NH41	348 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	OR56B4	Q8NH76	319 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		11.09	□□□□□ -0.63
VAMP1-208	ENST00000544432	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432		A0A1W2PPE3	182 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	SLC17A2	O00624	439 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	HSD17B6	O14756	317 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	OPN1MW	P04001	364 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	CD28	P10747	220 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	MAP2K4	P45985	399 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	PSMD7	P51665	324 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	HTD2	P86397	168 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	UNC119	Q13432	240 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	OR10K2	Q6IF99	312 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	GFI1	Q99684	422 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	GNG12	Q9UBI6	72 aa		11.08	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11.07	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	FGF16	O43320	207 aa		11.07	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	TXNL1	O43396	289 aa		11.07	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	WIPF1	O43516	503 aa		11.07	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	LPL	P06858	475 aa		11.07	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11.07	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	TMEM11	P17152	192 aa		11.07	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	CD1B	P29016	333 aa		11.07	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	GABARAPL2	P60520	117 aa		11.07	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	CD83	Q01151	205 aa		11.07	□□□□□ -0.64
VAMP1-208	ENST00000544432	FABP5	Q01469	135 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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