RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 SRP14P37108 136 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 RAC3P60763 192 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 PSG4Q00888 419 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 BSXQ3C1V8 233 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 NRN1LQ496H8 165 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 LCN15Q6UWW0 184 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 CALHM1Q8IU99 346 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 ADGRG7Q96K78 797 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 RSG1Q9BU20 258 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 DDA1Q9BW61 102 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 PLK3Q9H4B4 646 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 MANBALQ9NQG1 85 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 GAB2Q9UQC2 676 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 SHANK1Q9Y566 2161 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 XKRY2A2RUG3 117 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 TNFSF11O14788 317 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 TCAPO15273 167 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 HLA-HP01893 362 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 SERPINE2P07093 398 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 GALR1P47211 349 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 IQCJQ1A5X6 159 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 ZNF880Q6PDB4 577 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 COLCA1Q6ZS62 124 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 MKXQ8IYA7 352 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 DEFB119Q8N690 84 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 KCNE4Q8WWG9 221 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 OR6C1Q96RD1 312 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 FOXB1Q99853 325 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 PSENENQ9NZ42 101 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 LAMP3Q9UQV4 416 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.01□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 A0A0G2JRQ6 117 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 CD300LBA8K4G0 201 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 DEGS1O15121 323 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 ZNF737O75373 536 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 VENTXO95231 258 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 TIAF1O95411 115 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 MBP02144 154 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 EDN3P14138 238 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 BCL3P20749 454 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 RPL23P62829 140 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 PCOLCEQ15113 449 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 PDCD1Q15116 288 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 ADIRFQ15847 76 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 ACTL10Q5JWF8 245 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 PCSK4Q6UW60 755 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 AAED1Q7RTV5 226 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 SRXN1Q9BYN0 137 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 WDR54Q9H977 334 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 SH2D2AQ9NP31 389 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 ZNF716A6NP11 495 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 CBR3O75828 277 aa9□□□□□ -0.97
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CS-202ENST00000542324 HOXA6P31267 233 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 PSMB3P49720 205 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 LCN2P80188 198 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 ATP6V1FQ16864 119 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 SSX7Q7RTT5 188 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 LHX4Q969G2 390 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 OR51I2Q9H344 312 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 RBKSQ9H477 322 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 VSIRQ9H7M9 311 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 PROK2Q9HC23 129 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa9□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 B4E171 279 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 H3BP45 60 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 B4GALT1P15291 398 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 TSPAN7P41732 249 aa8.99□□□□□ -0.97
CS-202ENST00000542324 NUBP1P53384 320 aa8.99□□□□□ -0.97
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