RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 LINC00596Q86U02 117 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 DYRK2Q92630 601 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.34□□□□□ -1.23
THBS3-210ENST00000541576 CACNA1DQ01668 2161 aa7.34□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 FLNCQ14315 2725 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 AGAP20933 346 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 S100A12P80511 92 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 WDR82Q6UXN9 313 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 POC1AQ8NBT0 407 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 OR2V2Q96R30 315 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 AK3Q9UIJ7 227 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 HMSDA8MTL9 139 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 MPTX1A8MV57 137 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SNAPINO95295 136 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 F2RL1P55085 397 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 PRO1933Q9H354 126 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SPACA1Q9HBV2 294 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 HCFC1P51610 2035 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 E7EQL1 145 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 YIF1AO95070 293 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 HRH1P35367 487 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SERPINF1P36955 418 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 PMELP40967 661 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 MEF2DQ14814 521 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 HOGA1Q86XE5 327 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 OR4K15Q8NH41 348 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 NEUROG1Q92886 237 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ARL11Q969Q4 196 aa7.33□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 FAM221AA4D161 298 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 IGHV1-46P01743 117 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 PMP2P02689 132 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 PRB1P04280 392 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 AMY2BP19961 511 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 TBPP20226 339 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 TNFSF4P23510 183 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 S100A10P60903 97 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 MICBQ29980 383 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 HES4Q9HCC6 221 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 A0A1W2PPH5 198 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 DEGS1O15121 323 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SIAH2O43255 324 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ZNF44P15621 663 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 GLRA1P23415 457 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 DHRS2Q13268 280 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SPRNQ5BIV9 151 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 Q6ZPA2 131 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 NEK7Q8TDX7 302 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 LRRC29Q8WV35 223 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ITLN1Q8WWA0 313 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 IL19Q9UHD0 177 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.32□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 HSPB6O14558 160 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 HS3ST1O14792 307 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 WNT9BO14905 357 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 DTYMKP23919 212 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 IL13RA1P78552 427 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 DEFA6Q01524 100 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ZNF146Q15072 292 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 ACTBL2Q562R1 376 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 OR13C8Q8NGS7 320 aa7.31□□□□□ -1.24
THBS3-210ENST00000541576 SUCNR1Q9BXA5 334 aa7.31□□□□□ -1.24
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