RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529986.5

CTNND1-223, Transcript of catenin delta 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTNND1, Length 5,727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNND1-223	ENST00000529986	CTAG1A	P78358	180 aa		6.69	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	ZNF141	Q15928	474 aa		6.69	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		6.69	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	SERTM1	A2A2V5	107 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986		M0R3E3	92 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	MGP	P08493	103 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	DLX1	P56177	255 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	HFE	Q30201	348 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	COX19	Q49B96	90 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	OR4X1	Q8NH49	305 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	GPHA2	Q96T91	129 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	LRRC61	Q9BV99	259 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986		A0A1W2PP11	408 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	CXorf1	O96002	111 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	NAAA	Q02083	359 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986		A0A1W2PN81	502 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	LNP1	A1A4G5	178 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	ZNHIT1	O43257	154 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	LYZL6	O75951	148 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	HTN1	P15515	57 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	ERAS	Q7Z444	233 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	ZNF519	Q8TB69	540 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	FGF14	Q92915	247 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	RPE	Q96AT9	228 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	WDR34	Q96EX3	536 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986		K7ESF4	209 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	CDS2	O95674	445 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	HKR1	P10072	659 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	KIR3DL2	P43630	455 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	HERVK_113	P61574	105 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	LHX8	Q68G74	356 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	MARVELD3	Q96A59	401 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	SHISA7	A6NL88	538 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	HAND1	O96004	215 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	FXYD3	Q14802	87 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	ATRAID	Q6UW56	229 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	OR10D3	Q8NH80	312 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	VSTM2L	Q96N03	204 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	MYO7A	Q13402	2215 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	CCL7	P80098	99 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	PSG6	Q00889	435 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	PRNT	Q86SH4	94 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	CCL17	Q92583	94 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	SARAF	Q96BY9	339 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	TBX21	Q9UL17	535 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986		A0A1W2PPC4	97 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	CDIPT	O14735	213 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	CD74	P04233	296 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	RND3	P61587	244 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	OR4S2	Q8NH73	311 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	IP6K3	Q96PC2	410 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	FAM60A	Q9NP50	221 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	PRRG2	O14669	202 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	HOGA1	Q86XE5	327 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986		A0A1W2PPE3	182 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	FCAR	P24071	287 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	TAS2R60	P59551	318 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	TMEM240	Q5SV17	173 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	WDR31	Q8NA23	367 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	ZNF488	Q96MN9	340 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CTNND1-223	ENST00000529986	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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