RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	PLXNB1	O43157	2135 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	RGS10	O43665	173 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	FBXO24	O75426	580 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	SRM	P19623	302 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	FUT3	P21217	361 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAP2K4	P45985	399 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF134	P52741	427 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	UNC119	Q13432	240 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	MADCAM1	Q13477	382 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q6ZPA2	131 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR1L1	Q8NH94	360 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	NEK7	Q8TDX7	302 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	UFD1	Q92890	307 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM203	Q969S6	136 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPE	Q96AT9	228 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	ETAA1	Q9NY74	926 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	GHRL	Q9UBU3	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		10.11	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	TG	P01266	2768 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDCD6	O75340	191 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	MPIG6B	O95866	241 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	HBZ	P02008	142 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLA	P06280	429 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPE	P16870	476 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHAT	P28329	748 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	HTR2C	P28335	458 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	MNDA	P41218	407 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	EBI3	Q14213	229 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR8H3	Q8N146	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	TM2D1	Q9BX74	207 aa		10.1	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBE2QL1	A1L167	161 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSD17B6	O14756	317 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	CA11	O75493	328 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	OPN1MW	P04001	364 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	LPL	P06858	475 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBB	P0CG47	229 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSMCR30	P0CW71	290 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	REG1B	P48304	166 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB7A	P51149	207 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	ARHGDIB	P52566	201 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF137P	P52743	207 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD83	Q01151	205 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	FABP5	Q01469	135 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	SSX1	Q16384	188 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q3ZCU0	254 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q8N6K4	173 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	CNBD2	Q96M20	576 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	MGLL	Q99685	303 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	NICN1	Q9BSH3	213 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		10.09	□□□□□ -0.79
SH3BP2-222	ENST00000512014	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGKV1D-33	P01593	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGKV1-33	P01594	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM106CP	P0CH98	169 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSPA13	P48723	471 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNMT	Q14749	295 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	C6orf183	Q5T699	404 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1QL4	Q86Z23	238 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		10.08	□□□□□ -0.8
SH3BP2-222	ENST00000512014	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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