RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509677.5

SH3BP2-214, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-214ENST00000509677 MINOS1Q5TGZ0 78 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 TMEM86BQ8N661 226 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 OR4P4Q8NGL7 312 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 SETD6Q8TBK2 473 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF596Q8TC21 504 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 RAB3CQ96E17 227 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 CHIAQ9BZP6 476 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa14.76□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 A0A075B6Q4 140 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 BTBD17A6NE02 478 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 HBZP02008 142 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 HTR1DP28221 377 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 ALDH3B2P48448 385 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 SERPINB10P48595 397 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 GNG10P50151 68 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 PRRX1P54821 245 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 VBP1P61758 197 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 ACTG1P63261 375 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 GPR107Q5VW38 600 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 OLFML2AQ68BL7 652 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 GPR141Q7Z602 305 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 OR9G1Q8NH87 305 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 OR1L1Q8NH94 360 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 PTX4Q96A99 478 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 MALSU1Q96EH3 234 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 SSX3Q99909 188 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 MEGF9Q9H1U4 602 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 RAB9BQ9NP90 201 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 PSG11Q9UQ72 335 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 HILPDAQ9Y5L2 63 aa14.75□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 RAB27BO00194 218 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 F2RL2O00254 374 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 NAPSAO96009 420 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 IGLV1-47P01700 117 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 GNB3P16520 340 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 C16orf87Q6PH81 154 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 OR5H6Q8NGV6 325 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 DPM3Q9P2X0 92 aa14.74□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 A0A1W2PPE3 182 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 H3BUX3 64 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 J3QR06 171 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 MMP28Q9H239 520 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 GNG12Q9UBI6 72 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 KCNK7Q9Y2U2 307 aa14.73□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 LEUTXA8MZ59 168 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 LOXL3P58215 753 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 LY6EQ16553 131 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 Q6ZPA2 131 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 CROCCP3Q8IVE0 287 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 OR5R1Q8NH85 324 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 ETV7Q9Y603 341 aa14.72□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 MFNGO00587 321 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 GPR137BO60478 399 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 GABARAPO95166 117 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 CD3GP09693 182 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 RAB13P51153 203 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 SCAND1P57086 179 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.71□□□□□ -0.05
SH3BP2-214ENST00000509677 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms