RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAV20A0A0B4J274 112 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 RHBDL1O75783 438 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 OPN1MWP04001 364 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 OPN1MW2P0DN77 364 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 OPN1MW3P0DN78 364 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 OR8B8Q15620 311 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 Q3ZCU0 254 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC25A53Q5H9E4 307 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXJ2Q9P0K8 574 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 LNP1A1A4G5 178 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 PROB1E7EW31 1015 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 H0YL77 283 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 SYNGR2O43760 224 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 SEC11BP0C7V7 166 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 PSMB3P49720 205 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 MOB3AQ96BX8 217 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 VCANP13611 3396 aa11□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 SPRY3O43610 288 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC25A40Q8TBP6 338 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 TECTBQ96PL2 329 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM222Q9H0R3 208 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 F8VVB4 439 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 F8VWA3 439 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 MEOX2P50222 304 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 HGFACQ04756 655 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 NTNG2Q96CW9 530 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 TVP23CQ96ET8 276 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 PLEKHA3Q9HB20 300 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 OR2W1Q9Y3N9 320 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 H3BQ15 152 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 IRF2P14316 349 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 G6PCP35575 357 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 PMELP40967 661 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF83P51522 516 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5A2Q8NGI9 324 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 NABP1Q96AH0 204 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 CACFD1Q9UGQ2 172 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 TECTAO75443 2155 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 H7BYZ3 331 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 M0R1B8 84 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 CDS2O95674 445 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 FGF7P21781 194 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 GPR12P47775 334 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 ERVS71-1P61550 626 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 CEACAM21Q3KPI0 293 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM89BQ8N5H3 189 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM117AQ9C073 453 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 SERTAD4Q9NUC0 356 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5H1A6NKK0 313 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 FCGR3BO75015 233 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 YIF1AO95070 293 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 MMP9P14780 707 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 RAB5AP20339 215 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 F2RP25116 425 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 FGF12P61328 243 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 DLK1P80370 383 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC38A11Q08AI6 406 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 KCNMB1Q16558 191 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 UBAC2Q8NBM4 344 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 MALSU1Q96EH3 234 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 ZPBPQ9BS86 351 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 HSF4Q9ULV5 492 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 LAMP3Q9UQV4 416 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 MED13Q9UHV7 2174 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 HLA-GP17693 338 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 OR10D4PQ8NGN7 298 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 TCEAL7Q9BRU2 100 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 TM2D1Q9BX74 207 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 MTCH1Q9NZJ7 389 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 IGKV1-13P0DP09 117 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 NDUFB7P17568 137 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 CD200P41217 278 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 TAS2R30P59541 319 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF665Q9H7R5 613 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 CYTL1Q9NRR1 136 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 DNPH1O43598 174 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 TFF1P04155 84 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 SP1P08047 785 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF718Q3SXZ3 478 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 SPEGQ15772 3267 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5B21A6NL26 309 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 M0R1X1 148 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 H3F3AP84243 136 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM37Q8WXS4 190 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 ABHD14BQ96IU4 210 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 CLN8Q9UBY8 286 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms