RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497221.1

DUSP28-205, Transcript of dual specificity phosphatase 28, human

TSL 2

Gene DUSP28, Length 488 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DUSP28-205	ENST00000497221	DEFA6	Q01524	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221		Q499Y3	187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	GGH	Q92820	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	CORO2A	Q92828	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	GHSR	Q92847	366 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	SMIM19	Q96E16	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	COQ2	Q96H96	371 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	LALBA	P00709	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	MAS1	P04201	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	GNAO1	P09471	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	CEL	P19835	753 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	CD24	P25063	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	MNDA	P41218	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	GNG10	P50151	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	DYNLT3	P51808	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	WNT4	P56705	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	BDH1	Q02338	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	HES1	Q14469	280 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	RPE	Q96AT9	228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	SCN3B	Q9NY72	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221		A0A1W2PP11	408 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DUSP28-205	ENST00000497221		H3BMQ9	156 aa		4.61	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.1 ms