RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 BET1O15155 118 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TUSC2O75896 110 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 PPYP01298 95 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF728P0DKX0 622 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 AADACP22760 399 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CD83Q01151 205 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 C6orf183Q5T699 404 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DTX2Q86UW9 622 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 NRGNQ92686 78 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 GAFA1Q96PS6 74 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 RAB1BQ9H0U4 201 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM234AQ9H0X4 552 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 MAB21L2Q9Y586 359 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ROS1P08922 2347 aa8.95□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 C9orf170A2RU37 121 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM172BPA6NC97 362 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 A6NNC1 897 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 A8MV72 311 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SIGLEC5O15389 551 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF205O95201 554 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CD8AP01732 235 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 GYPAP02724 150 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DANCRP0C864 163 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 AKR1C4P17516 323 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 GLIPR1P48060 266 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 BAMBIQ13145 260 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DHRS2Q13268 280 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 PPP1R1AQ13522 171 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 HFEQ30201 348 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CCL17Q92583 94 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM230Q96A57 120 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 KIRREL1Q96J84 757 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DLL4Q9NR61 685 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 OPN4Q9UHM6 478 aa8.94□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 AKAP6Q13023 2319 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ODAMA1E959 279 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 C12orf77C9JDV5 145 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 SFT2D2O95562 160 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 FSTL3O95633 263 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ANXA3P12429 323 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 GZMHP20718 246 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CD34P28906 385 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 P2RX3P56373 397 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 FXYD4P59646 89 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 IL13RA1P78552 427 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 EDDM3AQ14507 147 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 KCNJ8Q15842 424 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CR1LQ2VPA4 569 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 C11orf88Q6PI97 169 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 MITD1Q8WV92 249 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 TOMM40LQ969M1 308 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CCL13Q99616 98 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.93□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A0B4J2A0 478 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 A0A1W2PPR1 153 aa8.92□□□□□ -0.98
ECHDC3-204ENST00000495787 NDUFA2O43678 99 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms