RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, human

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GAPVD1-218	ENST00000495588	PTHLH	P12272	177 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	IRF2	P14316	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	DAO	P14920	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	GNB3	P16520	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CPT2	P23786	658 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	NR4A2	P43354	598 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	RANBP1	P43487	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PITPNB	P48739	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TMEM50B	P56557	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF79	Q15937	498 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	HFE	Q30201	348 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588		Q6P435	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	RDH5	Q92781	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	RHOF	Q9HBH0	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	RASL12	Q9NYN1	266 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	DUX4	Q9UBX2	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	NPTN	Q9Y639	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588		V9GYH0	126 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588		A0A0G2JMP0	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588		A0A0X1KG70	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TMEM235	A6NFC5	223 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR2AT4	A6NND4	320 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	LGALS8	O00214	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SIRPB1	O00241	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MFNG	O00587	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SH2D1B	O14796	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	XRCC3	O43542	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	NDUFB4	O95168	129 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	HAND1	O96004	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	GYPA	P02724	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	PSG2	P11465	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF44	P15621	663 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TALDO1	P37837	337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ETV6	P41212	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	GABRA2	P47869	451 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	EFNA4	P52798	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	TAS2R20	P59543	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	BTG1	P62324	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SCN1B	Q07699	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	IL18	Q14116	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF146	Q15072	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CARTPT	Q16568	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	MPV17L	Q2QL34	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	AVPI1	Q5T686	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	STUM	Q69YW2	141 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588		Q6ZTK2	550 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	ZNF525	Q8N782	197 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GAPVD1-218	ENST00000495588	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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