RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa16.16■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 ACBD7Q8N6N7 88 aa16.16■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 SETD9Q8NE22 299 aa16.16■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa16.16■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 LGALS12Q96DT0 336 aa16.16■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 JAM3Q9BX67 310 aa16.16■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 HTR1AP08908 422 aa16.15■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 CCR9P51686 369 aa16.15■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 LRRC36Q1X8D7 754 aa16.15■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 C8orf31Q8N9H6 132 aa16.15■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 OR52M1Q8NGK5 317 aa16.15■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 OR5D14Q8NGL3 314 aa16.15■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 TM2D3Q9BRN9 247 aa16.15■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
NELFE-210ENST00000491139 TRIM64CA6NLI5 447 aa16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 SULT1B1O43704 296 aa16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 FADS2O95864 444 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 PPIFP30405 207 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 PXT1Q8NFP0 134 aa16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 ARL11Q969Q4 196 aa16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 LYSTQ99698 3801 aa16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 GHITMQ9H3K2 345 aa16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 EDA2RQ9HAV5 297 aa16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 WSB1Q9Y6I7 421 aa16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 CSMD3Q7Z407 3707 aa16.14■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 LDLRAD4O15165 306 aa16.13■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 TXNL1O43396 289 aa16.13■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 WBP4O75554 376 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 PIGYQ3MUY2 71 aa16.13■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 SERPINA12Q8IW75 414 aa16.13■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 SYS1Q8N2H4 156 aa16.13■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 DHRSXQ8N5I4 330 aa16.13■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 SUMF2Q8NBJ7 301 aa16.13■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 OR51J1Q9H342 316 aa16.13■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 GFOD1Q9NXC2 390 aa16.13■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 DAPL1A0PJW8 107 aa16.12■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 IRGMA1A4Y4 181 aa16.12■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 ERICH4A6NGS2 130 aa16.12■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 OR4C45A6NMZ5 311 aa16.12■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 C15orf65H3BRN8 121 aa16.12■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 IGLV1-40P01703 118 aa16.12■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 CAPGP40121 348 aa16.12■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 GALEQ14376 348 aa16.12■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 RSU1Q15404 277 aa16.12■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP16.12■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 UBALD1Q8TB05 177 aa16.12■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 STARD9Q9P2P6 4700 aa16.12■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 G3V318 75 aa16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 MYF6P23409 242 aa16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 VEGFCP49767 419 aa16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 RAB9AP51151 201 aa16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 Q3ZCU0 254 aa16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 PARP16Q8N5Y8 322 aa16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 OR10K1Q8NGX5 313 aa16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 FBLIM1Q8WUP2 373 aa16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 CYGBQ8WWM9 190 aa16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 GPER1Q99527 375 aa16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 AASSQ9UDR5 926 aa16.11■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa16.1■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 IGHV3-43DP0DP04 118 aa16.1■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 MMDQ15546 238 aa16.1■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 ACSM6Q6P461 480 aa16.1■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 SATL1Q86VE3 508 aa16.1■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 OR52I1Q8NGK6 324 aa16.1■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 ALG8Q9BVK2 526 aa16.1■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 ZNF581Q9P0T4 197 aa16.1■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 FAM90A10PA6NDY2 464 aa16.09■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 LINC01619G3V211 115 aa16.09■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 J3QLW9 94 aa16.09■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 GABRPO00591 440 aa16.09■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 ATP6V0E1O15342 81 aa16.09■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 SLC31A2O15432 143 aa16.09■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 MAGEB3O15480 346 aa16.09■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 ORC5O43913 435 aa16.09■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 HTR3BO95264 441 aa16.09■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa16.09■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 ZNF19P17023 458 aa16.09■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 ZNF137PP52743 207 aa16.09■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 SLURP1P55000 103 aa16.09■□□□□ 0.17
NELFE-210ENST00000491139 CCDC107Q8WV48 283 aa16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms