RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CEP170-216	ENST00000490813	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CEP170-216	ENST00000490813	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CEP170-216	ENST00000490813	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CEP170-216	ENST00000490813	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
CEP170-216	ENST00000490813	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CEP170-216	ENST00000490813		U3KQV3	271 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CEP170-216	ENST00000490813		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.28	□□□□□ -1.72
CEP170-216	ENST00000490813	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813		A0A1W2PN81	502 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	HMX3	A6NHT5	357 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	UBE2C	O00762	179 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SLC16A6	O15403	523 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	DEDD	O75618	318 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	TTR	P02766	147 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	IFNA4	P05014	189 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	FABP3	P05413	133 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CLU	P10909	449 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	HTR1F	P30939	366 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CHRNA7	P36544	502 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	GLP1R	P43220	463 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	MAP2K4	P45985	399 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	HMGA2	P52926	109 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CD81	P60033	236 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	PAX5	Q02548	391 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	MMD	Q15546	238 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CT83	Q5H943	113 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	GLYAT	Q6IB77	296 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	PYURF	Q96I23	114 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	NABP2	Q9BQ15	211 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	RETN	Q9HD89	108 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SAR1A	Q9NR31	198 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.27	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813		F8VVB4	439 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813		F8VWA3	439 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813		H3BUA1	57 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	DEGS1	O15121	323 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	DIRAS1	O95057	198 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	APOL3	O95236	402 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	HMGN1	P05114	100 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	TFAP2A	P05549	437 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	OCM2	P0CE71	109 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	AADAC	P22760	399 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	DUSP1	P28562	367 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	GNG10	P50151	68 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF137P	P52743	207 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	MTCP1	P56278	107 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	GK3P	Q14409	553 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813		Q6ZWC4	215 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813		Q8N1X5	172 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	RCN3	Q96D15	328 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	COQ2	Q96H96	371 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	SPACA5	Q96QH8	159 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.26	□□□□□ -1.73
CEP170-216	ENST00000490813	CHST5	Q9GZS9	411 aa		4.26	□□□□□ -1.73

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