RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 MNDAP41218 407 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 ARHGDIBP52566 201 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CLDN12P56749 244 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 LOXL3P58215 753 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 RAB11BQ15907 218 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 C6orf183Q5T699 404 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 ZNF773Q6PK81 442 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 OR2W3Q7Z3T1 314 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 PRR18Q8N4B5 295 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 DTX3Q8N9I9 347 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FCGR1BQ92637 280 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 RPEQ96AT9 228 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 CITED1Q99966 193 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAAP24Q9BTP7 215 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 A0A0A6YYD4 124 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SOCS1O15524 211 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 SPINT2O43291 252 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 HBZP02008 142 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 RANBP1P43487 201 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 OR10A3P58181 314 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 BLCAPP62952 87 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 MADCAM1Q13477 382 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 HES5Q5TA89 166 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 C22orf42Q6IC83 251 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 TRAT1Q6PIZ9 186 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM89BQ8N5H3 189 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 OR10X1Q8NGY0 326 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 OR1L1Q8NH94 360 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 TOMM40LQ969M1 308 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 ZNF702PQ9H963 129 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 TAF9BQ9HBM6 251 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 RAB9BQ9NP90 201 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 KCNIP1Q9NZI2 227 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.34□□□□□ -1.23
SYN3-211ENST00000472027 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 LDLRAD4O15165 306 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 FAM106CPP0CH98 169 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 RAB3BP20337 219 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 MYL9P24844 172 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 VEGFCP49767 419 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 RAB7AP51149 207 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ZNF134P52741 427 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 EFNB2P52799 333 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 TMEM50BP56557 158 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 PLA2G7Q13093 441 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 Q3ZCU0 254 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 FBLN7Q53RD9 439 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 PRR31Q5SQ13 230 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 C11orf88Q6PI97 169 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZS46 218 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZTK2 550 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 Q8N2B8 174 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 LINC00311Q8N616 119 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 OR2S2Q9NQN1 319 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 GNG12Q9UBI6 72 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 STUB1Q9UNE7 303 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.33□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 A0A1W2PPI3 338 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 IFITM5A6NNB3 132 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 TIMM23O14925 209 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 SLC31A2O15432 143 aa7.32□□□□□ -1.24
SYN3-211ENST00000472027 OR2F2O95006 317 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms