RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPR137BO60478 399 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 DIRAS3O95661 229 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 HTR1DP28221 377 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 ALDH3B2P48448 385 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM50BP56557 158 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 HTD2P86397 168 aa6.7□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 C16orf87Q6PH81 154 aa6.7□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.7□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 ING3Q9NXR8 418 aa6.7□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 DNHD1Q96M86 4753 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 A0A0A6YYH2 397 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.69□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 H3BUX3 64 aa6.69□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 STEAP3Q658P3 488 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 Q6ZS49 121 aa6.69□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.69□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 AK3Q9UIJ7 227 aa6.69□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.69□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 LEUTXA8MZ59 168 aa6.68□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 PRRX1P54821 245 aa6.68□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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TRAPPC3-206ENST00000469757 SSX2Q16385 188 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 CTF1Q16619 201 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR8H3Q8N146 312 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR1L1Q8NH94 360 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 RFESDQ8TAC1 157 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 NDNFQ8TB73 568 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 CCDC107Q8WV48 283 aa6.68□□□□□ -1.34
TRAPPC3-206ENST00000469757 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.68□□□□□ -1.34
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