RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468949.1

HDAC6-216, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-216ENST00000468949 FABP7O15540 132 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 ORC5O43913 435 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 SSX5O60225 188 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 RGS11O94810 467 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 TGFAP01135 160 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 HBZP02008 142 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 IFNA6P05013 189 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 CTXN2P0C2S0 81 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 CCL3L1P16619 93 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 TBPP20226 339 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 NFYBP25208 207 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 CD40LGP29965 261 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 GDNFP39905 211 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 TAS2R19P59542 299 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 STEAP3Q658P3 488 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 OR52W1Q6IF63 320 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 C16orf87Q6PH81 154 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 TMEM17Q86X19 198 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 HOGA1Q86XE5 327 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 GPX8Q8TED1 209 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 TMEM186Q96B77 213 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 KIRREL1Q96J84 757 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 SRRQ9GZT4 340 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 EHFQ9NZC4 300 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 ZNF69Q9UC07 566 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 KPTNQ9Y664 436 aa6.7□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 A0A096LNT2 108 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 CENPXA8MT69 81 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 C12orf77C9JDV5 145 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 J3QLI3 93 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 TOX4O94842 621 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 DIRAS3O95661 229 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 RBP4P02753 201 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 HNF1AP20823 631 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 OMGP23515 440 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 ZBTB25P24278 435 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 FPR2P25090 351 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 HLA-DMAP28067 261 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 HRH1P35367 487 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 PPP5CP53041 499 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 HERV-K104P61576 105 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 TSPAN5P62079 268 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 ARF6P62330 175 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 LSAMPQ13449 338 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 MEF2DQ14814 521 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 CDK10Q15131 360 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 HMGN3Q15651 99 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 ZNF79Q15937 498 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 NCR3LG1Q68D85 454 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 GAPTQ8N292 157 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 MFSD4AQ8N468 514 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 TEX29Q8N6K0 151 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 RFESDQ8TAC1 157 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 UBALD1Q8TB05 177 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 CORO2AQ92828 525 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 SMR3AQ99954 134 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 ABCB10Q9NRK6 738 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 MCUBQ9NWR8 336 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 KLK11Q9UBX7 282 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 JPT1Q9UK76 154 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 AUP1Q9Y679 476 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.69□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.68□□□□□ -1.34
HDAC6-216ENST00000468949 FAM172BPA6NC97 362 aa6.68□□□□□ -1.34
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