RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHV3-7	P01780	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	FCER2	P06734	321 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	TNFSF8	P32971	234 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRSS3	P35030	304 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	GDNF	P39905	211 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402		Q6ZPA2	131 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	PNKD	Q8N490	385 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR1L1	Q8NH94	360 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	GALM	Q96C23	342 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIRREL1	Q96J84	757 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	HLA-DQB1	P01920	261 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	MELTF	P08582	738 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	FPR2	P25090	351 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	IL18	Q14116	193 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	TNFRSF14	Q92956	283 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	LEAP2	Q969E1	77 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	GNG12	Q9UBI6	72 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	NUP50	Q9UKX7	468 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	HIVEP2	P31629	2446 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	MEIOC	A2RUB1	952 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	POM121C	A8CG34	1229 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRDC	B7Z8K6	153 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	SSX5	O60225	188 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHV1-69	P01742	117 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCT	P09683	121 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	SRD5A1	P18405	259 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	DTYMK	P23919	212 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	HLA-DRB3	P79483	266 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	HMGN3	Q15651	99 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	IFT46	Q9NQC8	304 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	FABP12	A6NFH5	140 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	TOR1A	O14656	332 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSPA12A	O43301	675 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARG1	P05089	322 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	GSTT2	P0CG29	244 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	GSTT2B	P0CG30	244 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIR2DS4	P43632	304 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	GNG10	P50151	68 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBE2E1	P51965	193 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	LGALS4	P56470	323 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIR2DS1	Q14954	304 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABHD1	Q96SE0	405 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	F2RL2	O00254	374 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	BET1	O15155	118 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	FABP7	O15540	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	CBX5	P45973	191 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	UTF1	Q5T230	341 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	HCP5	Q6MZN7	132 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	BEST4	Q8NFU0	473 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF69	Q9UC07	566 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A1W2PPE3	182 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	NPFF	O15130	113 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	CRLF1	O75462	422 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	LPL	P06858	475 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	EPHA1	P21709	976 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms