RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 IGHV3-13P01766 116 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 IGHV3-7P01780 117 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 RAB1AP62820 205 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 HLA-DRB3P79483 266 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 Q6ZRM9 215 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 TAAR9Q96RI9 348 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 KRASP01116 189 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 VDAC1P21796 283 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 KHDC3LQ587J8 217 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 DEPPQ9NTK1 212 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 PITX3O75364 302 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 EGR1P18146 543 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 HIKESHIQ53FT3 197 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 POM121Q96HA1 1249 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 PSENENQ9NZ42 101 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 KIAA1456Q9P272 454 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1B0GV90 55 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 IGHV2-70P01814 119 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 HNF1AP20823 631 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 OR2V1Q8NHB1 315 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 USF3Q68DE3 2245 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1W2PPQ1 181 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 GJE1A6NN92 205 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 PPIHO43447 177 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 CDS2O95674 445 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 AGBL5Q8NDL9 886 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 SDSLQ96GA7 329 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM234AQ9H0X4 552 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 ARV1Q9H2C2 271 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 GFOD1Q9NXC2 390 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 CST2P09228 141 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 S100GP29377 79 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 CLN3Q13286 438 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 SSX7Q7RTT5 188 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 LAMP3Q9UQV4 416 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM211Q6ICI0 200 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 CPT1CQ8TCG5 803 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP5SQ99766 215 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 DUSP23Q9BVJ7 150 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 TPRP12270 2363 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 GRPP07492 148 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 HOXA5P20719 270 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 LINC00205P59089 165 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 ARL16Q0P5N6 197 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 CARFQ8N187 725 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 CLDND2Q8NHS1 167 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM37Q8WXS4 190 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 TUBA4BQ9H853 241 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 Q9N2K0 584 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 GATAD1Q8WUU5 269 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 LHX4Q969G2 390 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 RBKSQ9H477 322 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 TAAR3PQ9P1P4 343 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF716A6NP11 495 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 C1orf87Q8N0U7 546 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 TPRX1Q8N7U7 411 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 SMIM7Q9BQ49 75 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 PCBD1P61457 104 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 SPEM1Q8N4L4 309 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 CLDN23Q96B33 292 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 IMMP1LQ96LU5 166 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM204Q9BSN7 226 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 DECR2Q9NUI1 292 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 UBE2G2P60604 165 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 SSX9Q7RTT3 188 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 GGNQ86UU5 652 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 ODF3L1Q8IXM7 274 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 DNASE2BQ8WZ79 361 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC39A9Q9NUM3 307 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 U3KQA8 63 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 IFNL4K9M1U5 179 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRJ-202ENST00000440289 SRPXP78539 464 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms