RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 ORAOV1Q8WV07 137 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 RASL10BQ96S79 203 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM9BQ9NQ34 198 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF732B4DXR9 585 aa7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM225BP0DP42 221 aa7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 CST6Q15828 149 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF709Q8N972 641 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.25□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 K7EQM0 130 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXS1O43638 330 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 YPEL1O60688 119 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2J2O76002 312 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 FMODQ06828 376 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF154Q13106 437 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 SGCBQ16585 318 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 MOB3AQ96BX8 217 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 C18orf12Q96KH6 178 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 YPEL2Q96QA6 119 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 PECRQ9BY49 303 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 OR51I2Q9H344 312 aa7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PNV4 684 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 NKX2-6A6NCS4 301 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF728P0DKX0 622 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXB2P14652 356 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 GABRG2P18507 467 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN17P56750 224 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS21P63220 83 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5AS1Q8N127 324 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 MANBALQ9NQG1 85 aa7.24□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.24□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 PBOV1Q9GZY1 135 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 VSIRQ9H7M9 311 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.24□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 PGAM5Q96HS1 289 aa7.24□□□□□ -1.25
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RABGEF1-203ENST00000439720 PILRBQ9UKJ0 227 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 C17orf51A8MQB3 221 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPAN2O60636 221 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 CDS2O95674 445 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 TAS2R30P59541 319 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL6IP1Q15041 203 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-203ENST00000439720 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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