RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 RBBP9O75884 186 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 SCTP09683 121 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 GATA3P23771 443 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 ERVFRD-1P60508 538 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP16.92■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 OR52W1Q6IF63 320 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 Q6ZS49 121 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 FAHD2AQ96GK7 314 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 KIRREL1Q96J84 757 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 MTFP1Q9UDX5 166 aa16.92■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 C17orf98A8MV24 154 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 GSTT2P0CG29 244 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 GSTT2BP0CG30 244 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 RCVRNP35243 200 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 PAX8Q06710 450 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 LSAMPQ13449 338 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 HEPN1Q6WQI6 88 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 GDPD1Q8N9F7 314 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 SNAPC3Q92966 411 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 GALMQ96C23 342 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 PCGF1Q9BSM1 259 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 SIRT7Q9NRC8 400 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 ANXA10Q9UJ72 324 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 ANAPC10Q9UM13 185 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 MMP23AO75900 390 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 TOX4O94842 621 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 RBP4P02753 201 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 IGHV1-8P0DP01 117 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 NFYBP25208 207 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 ARPC4P59998 168 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF846Q147U1 533 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 CHRFAM7AQ494W8 412 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 C11orf42Q8N5U0 333 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 Q8N7P7 452 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 OR4A4PQ8NGN8 299 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 SIRPDQ9H106 197 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 C7orf69Q9H7B7 122 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 LINC00574Q9H8X3 128 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 F8P00451 2351 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 TLN2Q9Y4G6 2542 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 FPR2P25090 351 aa16.89■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 GDNFP39905 211 aa16.89■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 VMO1Q7Z5L0 202 aa16.89■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 TSC22D3Q99576 134 aa16.89■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 AUP1Q9Y679 476 aa16.89■□□□□ 0.3
HOXA4-202ENST00000428284 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 F2RL2O00254 374 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 IGHV3-43DP0DP04 118 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 HLA-DMAP28067 261 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 DLX1P56177 255 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 IGSF11Q5DX21 431 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 OR2S2Q9NQN1 319 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 GNG12Q9UBI6 72 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 SLC23A1Q9UHI7 598 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 KCNS2Q9ULS6 477 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 SESN1Q9Y6P5 492 aa16.89■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 FAM172BPA6NC97 362 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 J3QLI3 93 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 BET1O15155 118 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 HSPA12AO43301 675 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 LANCL1O43813 399 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 CD5LO43866 347 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 FOSL1P15407 271 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 NAT1P18440 290 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 KRTAP1-1Q07627 177 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 HERPUD1Q15011 391 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 TRIQKQ629K1 86 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 OR10A7Q8NGE5 316 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM63Q969Q1 353 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 SUCNR1Q9BXA5 334 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa16.88■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 CSF1P09603 554 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 MMP9P14780 707 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 PRTN3P24158 256 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 PPP5CP53041 499 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 TAS2R46P59540 309 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 HTD2P86397 168 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 BAK1Q16611 211 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM30BQ3MIR4 351 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 OR5AP2Q8NGF4 316 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 OR52L2PQ8NGH6 319 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 OR10V1Q8NGI7 309 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 OR5H2Q8NGV7 314 aa16.87■□□□□ 0.29
HOXA4-202ENST00000428284 TBX15Q96SF7 602 aa16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms