RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 H3BSA7 217 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 J3QKU1 62 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 K7ERQ8 282 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 SULT1C2O00338 296 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 YKT6O15498 198 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 CDK14O94921 469 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB36O95755 333 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC35E2BP0CK96 405 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTSEP14091 401 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 GABRA3P34903 492 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 COILP38432 576 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKR1C2P52895 323 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXF1Q12946 379 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAPK14Q16539 360 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 CENPWQ5EE01 88 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACSBG2Q5FVE4 666 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 HES3Q5TGS1 186 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM25Q86YD3 366 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 MUC15Q8N387 334 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCAIMQ8N3R3 496 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4P4Q8NGL7 312 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMIGD2Q96BF3 282 aa1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP1.09□□□□□ -2.23
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa1.09□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 KMT2EQ8IZD2 1858 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 A8MWP6 167 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 J3QLI3 93 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR171O14626 319 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 OVOL1O14753 267 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHYHO14832 338 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 IGKV1D-12P01611 117 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR4A8P0C604 315 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIMS3P0CW19 117 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIMS4P0CW20 117 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFI30P13284 250 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 NQO1P15559 274 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPAM1P38567 509 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGEA6P43360 314 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 SULT1A2P50226 295 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 HADHBP55084 474 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB8AP61006 207 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 GTF2BQ00403 316 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 DEFA6Q01524 100 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR5D18Q8NGL1 313 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 CD200R1Q8TD46 325 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM210AQ96ND0 272 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 C11orf49Q9H6J7 331 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM216Q9P0N5 145 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCL26Q9Y258 94 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 FIS1Q9Y3D6 152 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 SORL1Q92673 2214 aa1.08□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRB1P82279 1406 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCTP09848 1927 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 OTOFQ9HC10 1997 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARAP3Q8WWN8 1544 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 UGT2B11O75310 529 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRYGDP07320 174 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 GP1BAP07359 652 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 P0DMU3 169 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM231AP0DMU4 169 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM231CP0DMU5 169 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPMP14384 443 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR2B6P58173 313 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP12-1P59990 96 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM3AP98173 230 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 BSPH1Q075Z2 132 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 HTR4Q13639 388 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDK2Q15119 407 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDGFRLQ15198 375 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYCP1Q15431 976 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBTB6Q15916 424 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF767PQ75MW2 155 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 DOLPP1Q86YN1 238 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 C17orf78Q8N4C9 275 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR5K1Q8NHB7 308 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUN5Q8TC36 379 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM56Q96MV1 263 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 HBEGFQ99075 208 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 GTSF1LQ9H1H1 148 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 TREM1Q9NP99 234 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM106BQ9NUM4 274 aa1.07□□□□□ -2.24
RNU6-78P-201ENST00000362897 HEY1Q9Y5J3 304 aa1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms